6月26日，在中央政治局与共产国际代表团召开的最后一次联席会议上，陈独秀直言不讳地说：
“我们有两条道路，一条是右的，一条是左的。右的一条是放弃一切，左的一条是反对一切。走这两条道路我们都将垮台。还有一条中间道路，就是把目前的状况继续下去，然而这也是不可能的。”“如果我们想在政治上独立自主，我们就应当退出国民党。”
陈独秀的倡言显然与共产国际的指示背道而驰，自然会遭到与会者的反对。
6月28日，第三十五军军长何健发表通电，要求武汉国民党中央和唐生智“明令与共产党分离”。至此，一切趋势表明，倘使共产党不主动退出国民党，很快会遭遇被驱逐的命运。
6月底，眼见武汉政权陷入危机，国共两党破裂在即，莫斯科突然紧张起来，不仅给中共发电打气，而且大笔汇款，称要通过武装工农，组建新军，“挽救革命”。然而直到这时，莫斯科仍旧坚持共产党“必须在国民党内”，给陈独秀与鲍罗廷的电报中明确指出：必须“使国民党民主化并让它领导群众性革命运动”。
为避免宁汉合流，莫斯科甚至决定汇给汪精卫数百万卢布。
对莫斯科的一厢情愿，陈独秀哭笑不得。他已经对共产国际不再报什么希望，从6月中旬便开始为国共关系破裂做准备，全力部署恢复湖南党组织的工作，组织农民自卫军对许克祥部进行反击，开展抗租运动。对敌军，他主张“大队来则避，小则与之打”。实在站不住脚的话，他赞成毛泽东的提议，上山。
可是，陈独秀没来得及做更多的部署，便已经无法继续工作下去了。
7月5日，陈独秀参加了最后一次中央政治局常委会议。鉴于“上面国际责难，下面同志非难”，尤其适应不了莫斯科的思维方式，陈独秀做出了辞职的选择，于7月12日离开了他为之呕心沥血操劳6年之久的中共中央。
7月15日，武汉汪精卫政府宣布“分共”，从此宁汉合流。
