明教东传
时光飞快，一晃四百年转瞬即逝。大概在唐高宗时期，摩尼教从回纥传入中国。武周代唐后，延载元年（公元694年），摩尼僧拂多诞持《二宗经》入中土，标志着摩尼教正式进入中国。
武则天代唐自立，急需一个宗教支持力量来宣传她是“正统”帝王。众所周知，武则天是佛教徒，迥异于李唐皇帝道教徒的身份，但武则天同时对摩尼教青睐有加，因为摩尼教迎合了武则天的政治需要。
摩尼教在《大云经》里宣称武则天是弥勒下凡，是净光天女，是东方“摩柯支那”（中国）的统治女皇，具有取代李姓皇帝的合法性。出于投桃报李，武则天改名武曌（日月当空），四处修建明堂和大云光明寺以示恩宠。两者各取所需，摩尼教在中国急速发展。
武则天死后归政李唐，唐武宗于会昌三年（公元843年）开始了声势浩大的毁僧灭佛运动，史称“会昌毁佛”。唐武宗的这次毁佛运动不仅仅针对佛教，其他的宗教包括摩尼教在内，都一视同仁地遭到了封杀。摩尼教好不容易在中土立住脚跟，又不得不转入地下发展。
从五代十国起，由于中华迭遭战乱，外人将摩尼教徒“食菜事魔”的习俗视为另类，摩尼教也就被讹传为“魔教”了。
两宋时期，摩尼教都未得到统治者的扶持，但在江南地区，摩尼教得到了如火如荼的地下大发展。《宋会要辑稿》记载说：“温州等处狂悖之人，自称明教，号为行者……斋堂如温州共有四十余处，并私建无名佛堂。每年正月内取历中密日，聚集侍者、听者、姑婆、斋姊等人，建设道场，鼓煽愚民，男女夜聚晓散。”可见已经形成较大规模。
两宋的皇帝都对摩尼教采取了取缔的姿态，“事魔食菜，法禁至严，有犯者，家人虽不知情，亦流于远方，以财产半给告人，余皆没官”，算得上是高压手段下的残酷镇压。哪里有压迫哪里就有反抗，为了保留摩尼教的中华火种，方腊、王念经、余五婆、俞一、陈三枪等摩尼教徒纷纷在各地发动了“妖寇”事变，给赵宋王朝沉重打击。具体反映到《射雕英雄传》中，就是黄裳剿灭治下的明教起义，孕育了《九阴真经》这本奇书。
元代，摩尼教日渐式微，而源于净土宗的白莲教却异军突起，摩尼教最终和弥勒教、明尊教等教派一起，融入到白莲教中，成为白莲教不可分割的一部分。
