基多水基金启动于2000年，起始的少量投资来自基多的公共用水管理部门和TNC。由公众和私人用水者、当地居民社区、原住民群体以及非营利性机构的代表组成的董事会监管基金，并决定如何分配收入。基多的电力部门在2001年加入了该基金，当地的啤酒公司“全国啤酒”（Cervecería Nacional）在2003年签字加入，灌装水厂特萨利亚泉水（Tesalia Springs）随后加入，它们都承认廉价而清洁的水源是企业发展的根本基础。
2006年，水基金获得了巨大的助推，基多市政府说服公共自来水公司将每年从用水户手上收取费用的1%投入到基金中。如果要修建过滤厂，自来水公司要付出的费用比这要高得多。
自来水公司把向集水区保护投资看作经济划算的风险管理办法。污染更少，切断水源供应的危险也就更小——而在拉丁美洲的其他地区，当山体滑坡污染了水道时，就必须切断水道——除此之外，显而易见的底线利益是，这样做可以避免修建新的过滤设施。水基金也促使自来水公司和其他股东能够协商确定共同的目标。鼓励私营企业与公共事业之间的对话在任何地区都不是一件小事，在发展中国家更是显得格外重要，因为人民往往对公共部门缺乏信任。而没有这种信任，想要在发展和环保两方面取得好的管理效果几乎不可能。
2011年年底，水基金的投资资金跟初创时相比增长了将近1 000万美元。现在，水基金投资年利息为80万美元，这笔钱主要用于调动配对补助金和共同出资，每年共计约300万美元，支持减少破坏帕拉莫、森林和水源的项目。基金投资数十个小型事务，比如增加公园警卫、支持群体性退耕还林，以及为溪流和河流修建把牲畜隔离在安全距离之外的围栏。基金同时支持由原本务农或养羊的妇女们经营的小型生意，比如提供缝纫机，让她们可以为远离基多的安第斯社区制作传统服装。基金同时也出资为原住民安装自来水管。
生态证据显示，水基金已经对帕拉莫产生了影响。尽管帕拉莫还未恢复到原始状态，但资源保护项目覆盖的地区要比被焚烧的其他地区更加良性。在最理想情况下，大部分的帕拉莫应该保持完整，而周围生活的人可以在不破坏它们的前提下维持生计。现实世界需要一些利弊权衡；稍有些受损的帕拉莫依然能为人类提供关键的生态服务，同时能保留大部分的生物多样性，这也许是目前能找到的最好办法。尽管不完美，但如果这种方法能在生态、社会和经济方面保持活力，可能也足够有效。
并不是所有的水基金项目都能取得这样乐观的效果。在尖端的资源保护中，有时候试验并不能取得预期效果。在一些地区，水基金出资雇用村民对已经为发展畜牧而进行了砍伐的地区退草还林。这个方案有着直接的吸引力，在厄瓜多尔也很受欢迎。但是退草还林成本高昂，尤其是与帕拉莫保护相比，所以很可能无法收回成本，至少在短期内困难重重。几十英亩土地退草还林的成本有时与恢复数千英亩帕拉莫相当。
