然而，对于一些囚犯来说，索洛韦茨基意味着比受苦和生病更糟糕的事情。在岛上，囚犯受到极其残忍而且毫无意义的虐待和折磨，这在古拉格后期——正如索尔仁尼琴所说，当时“强制囚犯做苦役已在深思熟虑之后成为一种制度”——是很难看到的。尽管许多回忆录描述了这些行为，最为详尽的记录却是在二十年代后期莫斯科派出的一个调查委员会所写的报告中发现的。在调查过程中，莫斯科的官员震惊地发现，冬天，索洛韦茨基的看守定期把衣不蔽体的囚犯关进大教堂寒冷的旧钟楼里，用一根绳子将囚犯的手脚绑在背后。他们还让囚犯“坐长凳”，就是强迫囚犯坐在长凳的一端十八个钟头不许移动，不时地把重物绑在囚犯悬空的下肢上，这种姿势肯定会给囚犯留下残疾。有时，囚犯被迫在结冰的天气光着身子去两公里以外洗澡。不是故意发给他们变质的食物；就是拒绝向他们提供医疗救助。平时，指派囚犯去做一些既无意义也没必要的事情，例如：将大量积雪从一个地方运到另一个地方，或是在看守高喊“海豚！”时从桥上跳进河中。
在档案资料和回忆录中均被提到的索洛韦茨基群岛所特有的另一种折磨囚犯的方式是“交给蚊子”。白军军官克林格尔——后来他策划实施了少数几次成功逃出索洛韦茨基的行动中的一次——写道，他曾亲眼见过用这种方式折磨一名囚犯，因为这名囚犯抱怨家人给他送来的一个包裹被没收了。恼羞成怒的监狱看守对他的抱怨作出回应，他们扒光他的所有衣服，包括内衣和内裤，然后把他绑在森林里的一根木桩上。在北方的夏天，森林里到处都有成群的蚊子飞来飞去。“不到半个小时，他那可怜的身体整个被叮得肿胀起来，”克林格尔写道。最后，这名囚犯因疼痛和失血而昏迷过去。
