建康城破
刘隗抵达建康以后，面见司马睿。他与刁协一起向司马睿进言，要求将王导一族全部诛杀，以绝后患。然而，司马睿却拒绝了这个建议。
司马睿没有选择与王氏家族彻底决裂，其原因固然与其和王导君臣之间长期的感情以及王导一直以来表现出的忠心不无关系，但是似乎与司马睿对于局势的走向没有把握也有一定的关系。
第一，王敦发动叛乱以后，王导没有像他的从兄王含那样选择逃跑，而是一直以一名罪臣家属的身份，带领全体成员每天到宫门外等待处罚。这首先就是一个态度问题，也说明了王导还是对司马睿忠心的，起码在表面上是这样的。留下王导，即使事情出现意外，身为家长的王导也可以充当制约王敦的一件武器，使之不至于走得太远。
第二，处罚整个王氏家族面临现实的困难。王氏家族过江以前就是琅邪的高门大族，过江以后更是一等一的豪门。经过王导等人的苦心经营，王氏家族已经俨然是一个王氏帝国。史称，仅王导自家就有田六十余顷，有田就需要有人耕作，那么部曲、门客、奴婢等就不在少数。况且，在王氏家族内部不少人虽然对刁协等人的做法十分反感，但对于王敦的忤逆行为也是不认可的。除此之外，王导以宰相的身份控制朝廷多年，势力盘根错节，在宫门外的王导时时让司马睿感到沉重的压力。如果在王导等人态度很好的情况下再予以严肃处理的话，将缺乏正当性。这样只会把整个王氏家族甚至包括倾向于王氏家族的其他大族推向王敦一边，并极有可能激发出建康的内乱。
第三，司马睿对中央的兵力是否能够战胜王敦并没有十足的把握。戴渊、刘隗的部队毕竟刚刚建军半年，与王敦训练有素的部队当不可同日而语。建康城内的兵力也不很充足，宿卫六军据《晋书·职官志》记载，“六军”是指中领军、中护军、左卫将军、右卫将军、骁骑将军、游击将军。十分薄弱。而且，王氏家族在宿卫六军中也是很有势力的，如王廙就是左卫将军，王邃为领军将军。而甘卓、陶侃均在千里之外，远水救不了近火。因此，朝廷未经战阵的军队与王敦的虎狼之师相遇，究竟能否取胜，尚属未知。如果此时与王氏彻底决裂，以后将没有一丝的回旋余地。
第四，激起王敦之变，当然是司马睿为了提高皇权。不过，司马睿采取的办法是利用刁协、刘隗等人，来分割王氏家族的权力。这说到底，还是一个君主利用大臣之间争斗搞的一种平衡。如果把王氏家族斩草除根的话，司马睿势必面对一个刁协、刘隗一支独大的问题。即使是战胜了王敦，留下受到重创的王导作为刘隗、刁协二人的掣肘，亦无不可。
于是，在刘隗回师建康之前，通过周顗的极力斡旋，司马睿就已经拿定了继续利用王导的决心。因此，在刁协、刘隗二人向司马睿建议诛杀王氏家族的时候，司马睿断然否定了这个意见。刚才还在群臣面前谈笑风生的刘隗陡然感到了极大的不安，不过他还是顺从地接受了司马睿的命令，率部前往金城驻守去了。
送走了刘隗，司马睿命人将王导上缴的朝服退还给了王导，并在宫中予以接见。走进宫中，王导顿首谢罪说：“乱臣贼子，哪个朝廷没有啊？我没有想到今天竟然出现在臣下的家族里！”王导对司马睿的这番话，是给王敦的行为定了性，即王敦是乱臣贼子。而王导内心深处真的就是这么想的么？
而此时，司马睿表演得更是出格。他连忙将王导扶起，像朋友一样亲昵地称呼着王导的字，说：“茂弘啊，我正要把建康城方圆百里臣民的身家性命，都拜托给你呢，瞧你说的这是啥话啊！”好像过去剥夺王导权力，试图铲除王氏家族，都与他毫无关系似的。
