1861年,咸丰皇帝在热河去世,圆明园被英法联军烧毁。等到合约签订后,两位太后垂帘听政。恭亲王是议政大臣,他首先指定的政策,就是依靠外国军队平定内患。当时农民军占据长江流域,政府非常担忧,因此不惜借助外国军队,这不是很奇怪的事情吗?但这真是中国政府高明的地方,因为当时长江是通商地区,外国人明白这一点,因此英国、法国早就想出兵了。关于常胜军的历史就不再详细记述了。1862年,常胜军在江苏围剿农民军。1863年2月,英国政府允许戈登在中国带领常胜军,帮助戡乱。此后官军的声势大振,曾国藩得以平定战乱,使中国重新太平,戈登为清政府平定战乱做出了很大的贡献。1863年12月,苏州被收复,次年7月,南京被收复,洪秀全去世,战乱平定。一开始外国政府都主张中立,后来帮助清政府剿灭农民军,西方人不惜以生命的代价帮助清朝,这份情谊很重,就连法国的海军提督都在中国战死。
南京城被收复后,曾国藩上奏朝廷的奏折,以及朝廷的诏令,都不曾提到戈登的功劳。曾国藩在奏折中把功劳归于死去的咸丰帝,这是中国的传统,认为皇帝是神圣和无所不能的。这样的心理,不只在中国,日本也很明显。在战胜俄国之后,其将领把功劳归于天皇,和中国基本一致。在中国,凡是因为国家而死的人,政府给予的待遇,那是活着的人比不上的。如果外国人有功劳的,那更比不上了。曾国藩有勇有谋,但在这件事上态度的转变,让人感到薄情寡义。戈登将军虽然帮助平定战乱,但也随着英法联军攻入京城,烧毁圆明园,因此曾国藩不在奏折里提起他的功劳。
慈禧见到南京收复,心里很高兴,以皇帝的名义下达一道诏令,其抄录如下,可以看到她的性格,诏令中说:
此次洪逆倡乱粤西,于今十有五年。窃踞江宁,亦十二年。蹂躏十数省,沦陷数百城。卒能次第荡平,殄除元恶,该领兵大臣等栉风沐雨,艰苦备尝,允宜特沛殊恩,用酬劳绩。钦差大臣、协办大学士、两江总督曾国藩……筹策无遗,谋勇兼备,知人善任,调度得宜。曾国藩著加恩赏加太子太保衔、赐封一等侯爵,世袭罔替,并赏戴双眼花翎。浙江巡抚曾国荃……坚忍耐劳,公忠体国。曾国荃著赏加太子少保衔,赐封一等伯爵,并赏戴双眼花翎。