作为开创“弘治中兴”的仁君，朱祐樘是极其刻苦好学的一位，他做太子的时候，每逢读书上课，听讲都格外专心，也极其有礼貌。老师讲课出现错误，他并不当场指出来，而是用沉默的方式来提醒老师，既坚持自己，又尊重老师的尊严。而他对于文臣的礼敬，也从此终其一生。
朱祐樘与父亲朱见深有一个相同点，就是善于耐心听取别人的意见。但两人的不同点是，朱见深经常只听不做，朱祐樘则只要觉得对，就立刻做。《明史》上对他记录非常多的就是他的“勤于纳谏”，比如吏部尚书王恕要他把全国各地官员的名字贴在皇宫柱子上，以便随时查阅，朱祐樘当天就贴上了。兵部尚书马文升要朱祐樘节省宫廷开支，朱祐樘立刻下令，从当月的开支开始削减。礼部尚书丘浚给朱祐樘上《大学衍义补》，朱祐樘阅后很高兴，立刻下令福建地区刻印，全国发行。外表温和的朱祐樘，做事却是个风风火火的人。
朱祐樘执政时代，和父亲朱见深相比，最大的差别就是效率。“弘治中兴”时期，中央政府机构有明文规定，对已经熟悉的奏章，处理时间不能超过两天，对不熟悉的奏章，处理时间不能超过三天。对需要不同部门联合处理的奏章，处理时间不能超过十天。特别重大的军机事件，处理时间最多宽限五天。朱见深在位时代人浮于事的局面，一度大为扭转。
被看做“守成之君”的朱祐樘，在位期间做的最重要改革，就是“折纳银钱”制度，即在收取赋税时，允许农民将应缴粮食中的一半，用白银来充缴。这个看似不起眼的制度，从弘治五年（1492）实施开始，就极高地提高了政府税收。而且在之后的近百年里不断完善，到了八十年后的万历时代，它有了一个著名的称呼--一条鞭法。
朱祐樘得到后世称颂的，除了他的勤政与人品外，就是他对文臣的优礼，比如他极其信任的左都御史戴珊。弘治十八年（1505），朱祐樘接见戴珊时，特意赠给他一锭白银，并解释说，这一点钱，多少能够表彰戴珊的廉洁。皇帝给臣子送钱，明朝并非首例，但仅为表彰道德，确为首例。戴珊晚年，多次请求退休，朱祐樘对戴珊说：“我把天下大事交给你，就像对待家人一样，而今太平盛世尚未实现，怎么能说走就走呢？”闻言的戴珊流泪说：“我只有死在任上了。”
