一些批评家不断地在问科学是否已陷入困境，还有一些人在问科学是否已令我们失望。当我们试图转向其他信念系统寻求帮助去理解这个世界时，其实我们已经在这一过程中逐渐变得成熟。比如，当3世纪出现早期基督教教堂时，人们相信新的宗教可以回答人类生存的本质问题。但随着宗教的逐渐成熟，以及那些追随这些信仰的人的思想逐渐成熟，这些信念也不断地改变。因此，尽管教堂依然是很多家庭和社区的社会活动核心，但它能否回答生活中所有问题却开始受到质疑。
我们可以说现在的世界比过去美好，生活水平也提高了很多，这都是科技带给我们的好处。当然，科学在某些方面是对的，而且我们将继续从科学突破中受益，比如医学的进步使我们的寿命得以延长，甚至延长超过10年以上。但是，在另外一些方面，科学观点的分歧和不一致却成了我们探索生命和自然之谜的巨大障碍。这些都是科学发展的拦路虎，比如构成科学信念根基的那些不完善的理论……不可持续的看待人类自身的方式。
除了科学家一直认为的基因和蛋白质存在一一对应关系的想法，以及那些现在我们知道其实不存在的一些事实，科学发展的障碍还包括我们依然无法解释使量子纠缠成为可能的能量场，进化论依然无法解释生命和人类的起源，以及我们依然无法找到证据来证明人类历史的先进文明其实是文明周期发展的一部分。
传统思想依然无法回答人类生存的本质问题，这一事实让人不得不怀疑我们赖以认识世界的传统思维方式。科学方法认为，当新证据不再支持已有的思维方式时，就是该“重新思考”这一思维方式的时候了。随着越来越多的科学发现否定了我们旧的理念，那些在过去不被人们接受的科学证据也得到了验证；这些科学证据必须融入到主流科学中去。正如在接下来的部分所要介绍的那样，正是以下一些错误想法妨碍了科学成为看待世界和人类在世界中作用的最佳方式。
想要以科学的方式来化解这些危机，就意味着在21世纪我们必须像100年以前的物理学家那样去做他们已经做过的事。就像他们转变思想来接受量子理论的证据一样，我们也必须转变思想，为那些推翻了我们最珍视的科学信仰的最新发现留有余地。如果无法做到这一点，我们就会被困在这些信仰和固有的生活方式之中，像现在这样走上毁灭之路。
