钱玄同在教学上极为重视引发学生的思考，而不重视学生的考试等技术问题。著名语言学家魏建功在钱玄同逝世7周年后，写了《回忆敬爱的老师钱玄同先生》一文，文中讲到了钱玄同的教学风格：“先生（指钱玄同）的伟大在‘循循善诱’而‘无拘牵挂碍’地引导后辈。只有我相随十多年才晓得先生这一点美德，是若干旧或新的为人师者所不及！中国学问，往往只许老师包罗了一个大圈子，他的学生只算是大圈子里的若干小圈子，如此，学生的学生一辈一辈传下去，不应该也不敢向圈子外延长一点儿。学术何以得进步呢？这现象自古有之，于今犹烈！我的先生，他从来不对人说他有哪一个学生的：这，我懂得的，他不轻易承认是谁的先生也就是不轻易许可哪一个人配当他的学生。例如他对人的称呼：凡是大学里的学生，他一概称‘先生’；等相处熟，才改称‘兄’……先生在这些小节上，不知者以为很脱略，实际是极严肃的。一面保持严肃，一面酷好自由；所以先生对我们论学，不但不遏抑我们的玄想，并且还从而助长。我是狭陋地研治了先生所长的学问的一部分，文字语言之学，他并不求全责备，偶尔关于经学史学的问题也对我谈及。当我注意某些问题，提向先生请益，往往接着的回答都是：‘这问题呀，我曾经注意过。’这样以后，他叙述了自己一段意见。我有时把我不同的意见说出，先生多半说明他不以为然的理由，之后又说：‘不过照你的讲法，……’以下就完全站在我的观点上替我加以解释，替我想证据。如此成就了我若干学说的取舍信念。这样，学问的进展，师徒相承正似许多圈链上下相联着，可以延引至于无穷。我惭愧：治学既无以继先生，教人亦不能如先生；愿将先生如此盛德传告国人！”
对于钱玄同富于启发性的教学风格，有一个生动的例子可以证明。据说在一次音韵学课堂上，钱玄同讲到“闭口音”与“开口音”，有个学生站起来请他举个例子说明二者的区别。于是他讲了一个简短的故事来做说明——
北京有个唱京韵大鼓的美女，她有一口洁白整齐的牙齿，十分引人注目。后因一次事故掉了两颗门牙，使她在宴会上坐在宾客中很不自在，于是她就尽量避免讲话，万不得已有人问话要答话时，就全用“闭口音”回答。如问：“贵姓？”答：“姓伍。”问：“多大年纪？”答：“十五。”问：“家住哪里？”答：“保安府。”问：“干什么工作？”答：“唱大鼓。”这位女艺人把掉的牙齿补好了，再在宴席上与人交谈时，就全用“开口音”，以炫耀她的一口美牙。如问：“贵姓？”答：“姓李。”问：“多大年纪？”答：“十七。”问：“家住哪里？”答：“城西。”问：“干什么工作？”答：“唱戏。”
这个故事可谓言简意赅！
而对于考试，钱玄同则相当不重视，当他在燕京大学兼课，钱玄同仍坚持不批学生考卷，就行不通了。他考卷不看，交与学校。学校退回，他仍是不看，也退回。于是校方要依照学校的制度制裁，说如不判考卷，将扣发薪金云云。钱玄同又一次表现了他的“特行”：钱玄同作复，并附钞票一包，云：“薪金全数奉还，判卷恕不能从命。”言下之意是，你们的制度我固然会遵守，而我的原则也同样是不能动摇的。
1937年“七七事变”之后，日本侵华战争全面爆发，不久，北师大西迁，钱玄同身体已经十分虚弱，他不能随迁而成为留守者。坚守故园的钱玄同在给远在西北的好友黎锦熙的通信中表示：“钱玄同决不‘污伪命’。”原来，在北平（即北京）沦陷以前，他认为凡去伪满和冀东伪组织求职和授课的都叫“污伪命”。次年，他又对北师大秘书汪如川说：“请转告诸友放心，钱某决不做汉奸！”真是铁骨铮铮，掷地有声！1939年1月17日晚6时，正准备吃晚饭，钱玄同突然感到头晕，随即，他被送往德国医院医治，但当晚9点多，钱玄同这位引领时代风气的一代宗师，满怀对家国的忧虑的爱国教授就永远地停止了呼吸，享年52岁。在他身后，北师大和他的同事、好友、学生纷纷对他进行了追悼。而国民政府也于同年7月颁发了褒扬令，深赞他精湛的学识和高洁的品行。
