蒋介石三番五次地要求撤换季山嘉的根本原因是两人在北伐时机问题上出现分歧。蒋介石从汕头回到广州后，在国民党第二次代表大会期间，就北伐问题提出一项议案，认为“革命根据地之广东将近统一，革命基础逐渐巩固，行将秣马厉兵，出定中原。”
经过第二次东征，“攻克惠州，收复海陆丰，再定潮梅。接着又削平南路与海南邓本殷叛部，重奠广东统一的局面。”蒋介石由此相信，广东既然已经统一，那么，“国民政府的使命就是出师北伐了”。汪精卫对此也表示赞成，还“准备北伐款项以示决心”。鲍罗廷对此“亦未表示异议”。可是，2月7日，蒋介石同季山嘉讨论当前政局与军队组织问题。他感觉季山嘉“语多讽刺”，而且对自己有“疑惧”。这次会谈，给蒋介石留下了不好的印象。特别是在北伐问题上，季山嘉给蒋介石迎头泼了一盆冷水，他不仅不赞成北伐，反而劝蒋介石到北方去帮助冯玉祥练兵。
对苏联来说，从地理位置上讲，广州毕竟离莫斯科太远。相比之下，苏联人更重视冯玉祥的所谓“首都革命”，急于谋求改变北京政府的现状，以期中国革命迅速发展，这对苏联的外交形势更为有利。因此，莫斯科“天真地要求蒋介石到北方去发挥不平凡的作用。苏俄这些土包子军人在鲍罗廷走后，一下要担起折中的重任，政治手腕过于笨拙，以致引起了蒋氏的反感。”结果，蒋介石确信，莫斯科在北方支持冯玉详，重视国民军的势力，季山嘉让他去帮助冯玉详，这是“打消北伐根本之计”，使北伐“坐失时机”。蒋介石还感觉到，季山嘉劝他到北方练兵，“其虚实诚伪已彰明较著”。只要他在广东多呆一天，季山嘉的计划“总难实现”。所以，季山嘉不得不设法让他离开广东，“以失去军中之重心”，从而削弱国民党的势力。结果，蒋介石同季山嘉“反脸”，还打算“赴俄修养”。汪精卫因害怕激怒季山嘉，便催促蒋介石“速行”。蒋介石对此感到很恼火，他告诉汪精卫，他决不会因为一个苏联顾问的喜怒而“定去留”。
使蒋介石感到不满的还有一件事，这就是军费问题。国民政府军事委员会起初决定支付给黄埔军校的经费为30万粤元，第二师为12万。可是，第二天，黄埔军校的经费被减少至27万，而第二师的经费却增加到15万。蒋介石责问汪精卫，参谋团为什么推翻原定的议案，擅自减少军校的经费是谁主持的？汪精卫支支吾吾。蒋介石不会不明白，推翻军事委员会的议案，擅自减少黄埔军校经费，这决不是一件小事，难道汪精卫会不知道？蒋介石断定，这一定是季山嘉在“倒行逆施”。
由于同季山嘉的矛盾不断恶化，在同季山嘉谈话的第二天，蒋介石表示不愿意就任国民革命军总监一职，并且于2月9日请求辞去军事委员会委员及广州卫戍司令，只保留国民党中央政治委员和黄埔军校校长职务。2月11日，蒋介石在日记中写道：“苏俄同事疑忌我、侮弄我”。2月22日，蒋介石出席苏联顾问举行的宴会，而气氛又使蒋介石感到不愉快。因为“席间座谈，多主北伐从缓。”
