何键"治湘"期间，"剿匪反共"甚力。他1929年任湘赣两省清剿总司令时，负责对井冈山区的进攻，迫使红军主力离开井冈山根据地南下赣南，创建中央苏区。他在湖南杀赤化分子是极有名的，曾制造了震惊全国的"龙门惨案"。经何键铁腕镇压之后，原来是农民运动发源地后来又爆发过秋收起义的湖南，居然基本上没有了红军的立足之地。但1930年7月，彭德怀部红三军团趁"讨桂"之战的混乱，突袭平江、长沙，占领省会长沙达十天之久。何键事后报复时，拘捕了著名共产党人向警予和杨开慧，并下令处死。
何键也曾想重振湖南本省的军力，成立了省政府下属的航空署，聘请了飞行员，从国外购进了十架战斗机。但飞机到货时，就被蒋介石扣下了六架，说四架已足够省内防务之用。而到江西清剿红军的战争接近尾声时，老蒋更进一步逼迫何键交出全部湖南省的兵权。何键不敢违抗，把湘军四个师和四架飞机都交了出去，从此自己只当文职的湖南省主席。
到了1937年抗战爆发，蒋介石已经意识到当年蒋百里所预言的：湖南将成支撑抗击外敌的关键地区，于是命令何键交出湖南省的政权，调他到南京任内政部长，派自己信得过的张治中（字文白）当了湖南省主席。然而就在张治中的任内，发生了震惊全国的长沙"文夕大火"。何键在离任省主席之前，断了最后一个案子：下令枪毙了一个妇女，理由是她竟然嫁给了日本商人为妾。那日本人已经撤侨离去，他的中国小妾不但有"通敌罪"，而且贬辱中华女性的民族气节，所以罪不可赦。与此同时，何键给陕北的毛泽东发出电报，当然不是提杨开慧之事，只是称国难当头，今后并肩与日寇作战，休戚与共义无反顾。
蒋介石将何键调往南京任职后，逐步把湘军抽调一空，几乎全部送上了抗日的前线，就连负责地方治安的保安团队也不例外。而且湘军出湘抗日，都是分别编入不同的部队，分割使用，不使其仍形成集团。国难当头，有"无湘不成军"之誉的湘军倒是都没有给家乡父老丢脸，无论在哪个战场上，作战都极为英勇顽强。特别是在淞沪之战中，湘军损失惨重，即使没有全军覆没的部队，也继而被编散了，取消了番号。老蒋这样做，自有他消灭异己统一政令的用心，但借外敌之刀杀自家兄弟，不能不令国人齿冷。民国时期从辛亥革命后建立起来的湘军，历经内战的磨难，终于消亡于抗日的战场上。作为最后一个湘军统帅的何键，眼看着三湘子弟兵灰飞烟灭，心情一定是非常悲凉的吧。
何键在南京任内政部长后，随中央政府撤到"陪都"重庆，在1939年差点因一个误会被老蒋杀掉：那时他的结发妻子黄氏在香港病逝，何键获悉后想去香港为妻治丧，向行政院长孔祥熙告假一个月，孔祥熙准假。可就在他准备登上飞机离开重庆的时候，戴笠亲自赶到机场，命令停飞，并登机检查何键有无蒋介石亲笔批准的假条。何键拿出孔祥熙的假条，被戴笠拒绝，并将何键拉下飞机，当即软禁起来。
原来此时因汪精卫叛国后，重庆有一些官员偷偷赴港转投南京伪政府，老蒋令戴笠对要去香港的官员严加盘查，何键正撞在枪口上。后来经孔祥熙出面澄清，老蒋才放了何键，但还是撤了他的内政部长职务，改任抚恤委员会主任委员。之后何键知道自己再也不能乱说乱动，一直老老实实任这个闲差。何键1949年迁居香港，1950年到台湾，又当上了"总统府国策顾问"，1956年病逝于台湾。
