朱见深与万氏疏远了，他不再定期出现在她的昭德宫中。这一方面是随着时间的无情流逝这个女人已风华不再，再也引逗不起他的情欲，更重要的是通过这件事，他认清了这个女人美貌下面的阴毒和蛇蝎心肠。他意识到有必要对这个女人有所防备，以保护自己的后代不受伤害。这个女人在宫中基本上成了一个类似美女蛇的角色，内侍、宫女避之惟恐不及。皇帝的母亲周太后甚至警告她保护下的孙儿，即那个尚在幼年的太子，如果推脱不掉不得不去万氏的寝宫时，千万要拒绝一切饮食以免遭到毒手。皇帝的私生活变得放荡了，在春药的鼓荡和无耻的朝臣们进贡的房中术读物的指导下，他成功地使宫内一大批适龄妇女怀孕，并让她们为他生下了十七个子女。
内廷、皇后与外戚
朱祐樘的童年有着太多的禁忌。不能大声说话，不能自由奔跑。作为皇帝与一个地位低下的宫女一夕欢娱的产物，他尚在腹中时就遭到了控制整个后宫的万贵妃的忌恨，以至差点儿不能降生到这个世界。在好心的太监的帮助下，他的母亲纪氏在东躲西藏中终于生下了未来的皇帝。惊惧再加营养不良，使得这个孩子一生下来就显得非常瘦弱和胆小，几乎就像一只病猫。从他成年后的画像来看，一双细长明亮的眼睛，颏下几缕飘逸而稀疏的胡须，似乎表明他更多地接受了来自母亲一系的基因。的确，把有明一代十六个皇帝的画像放在一起看，从朱祐樘起的几个皇帝开始更多地呈现出南方人的外表和气质。
他在遗忘中长大。如兔子般东躲西藏的经历养成了他机敏的个性和对人的不信任感。当他在1475年终于被求子若渴的父亲承认，忌妒和迫害的火焰还是追着他。在这样一个充满着不祥气氛的宫中，他的身份被公开后更可能招致暗算。关键时刻，他的祖母，那个饶舌的、爱吵架的周太后出面了，她愿意抚养他，像老母鸡一样张着翅膀不让他受到万贵妃的伤害。但他母亲还是被万贵妃派人给暗中毒死了。这一不幸的事件肯定曾让他伤心欲绝，并影响到了他对世界的态度。这个孩子的不幸遭遇也激起了大臣们的同情，他受到了更多的庇护和照料。出于对母亲的怀念，当他在1487年（成化二十三年九月）登基后，所做的第一件事就是宣布早已不在人世的母亲为皇太后，并派官员到广西去寻找她的家族。有冒名顶替者，旋被揭露，但始终没有发现她尚在人世的亲属。年轻的皇帝命令在广西和京师建造纪念她的祠庙，这一出于强烈虔诚心的孝行得到了文官们的一致赞同和拥护。
正因为这一足够坎坷的经历，使得比之父亲和祖父他的身上较少纨绔荒唐的习气。在他执政之初，已近糜烂的朝政也出现了复苏的气象。一批公认品行不端的内外官员遭到了黜退，他父亲在位时蜂拥到京师的多达千人的方士僧人被遣散，作恶多端的大臣李孜省被下狱论死，朝会时但知口呼万岁圣明的尸位素餐的阁臣万安也被勒令致仕还乡（但接替他为内阁首辅的刘吉仍是一个阿谀奸诈之徒），一批公认品德端正的官员被提拔到了重要位置上。
