这两种分别由官方和民间得出的截然不同的结论，让港人满脑子疑团。为什么会出现如此严重的分歧？有香港学者猜测，这很有可能与近期枯水期有关。香港大学地理系副教授吴祖南分析说，冬天水落石出，东江水大为干枯，污染物就比全年平均数高许多。这就是说，由于季节和气候的影响，在个别月份东江水水质可能会特别差，这也会对市民生活构成影响，他建议香港特区政府应该每月公布水质报告。“绿色和平”总干事廖洪涛也承认水质可能只属季节性恶化，但是水务署为清理净化饮用水，必须采用更多化学物质进行消毒，市民最终会把这些化学物质喝进肚里。他还批评，自密封管道启用后，邻近东江而受严重污染的石马河水量急降，每遇潮水涨退，就会倒流至东江中游，严重污染东江源头。
尽管“绿色和平”的数字里明显有些偏激和夸张的成分，但广东省水利厅也坦率地承认了东江支流石马河的污染，不是严重，是极严重，他们正在抓紧制订整治污染的计划。坦率的承认比遮遮掩掩好。石马河的污染程度是有目共睹的。一条石马河从深圳宝安龙华镇大脑壳山流过来，在河谷里浑浊地流淌着的污黑的液体并散发出刺鼻的臭味，几乎看不出水的丝毫光亮，唯一发亮的东西就是漂浮在河流上的塑料垃圾袋。很多人不叫它石马河，而叫它“黑龙江”，乌黑的河流就像一条黑龙。30多年前的石马河不是这样子，那时的石马河流域，在明媚的阳光下呈现出来的是碧绿的原野、满山遍野的果园和偏居一隅的岭南民居。可惜，那缓慢而宁静的乡村田园风景，在30多年的岁月里早已被无数工厂和坚硬的钢筋水泥建筑淹没了。现代化的坚硬的阳光，到处发出金属的响声。这石马河畔的每一个曾经的乡村，现在无疑是复杂的，比所有的时代都复杂。这也是我反复重复的一个感叹，你不知道，她是乡村，还是城市？是小镇，还是都市？你已经无法为这样一片土地定义。这里的土地正在被水泥一块块地吃掉，这里的河流里也能看见繁华的大街与楼群。一个桥头，现在每年就能创造出40多亿的财富和6亿多美元的外贸出口额。在这样一个地方我走得很慢，我只能以萨特式的眼光，迷惘而怀疑地打量着这里正在发生的一切，尤其是在改革开放的最初10年，一股股乌黑发臭的工业废水和生活污水直接就排进了石马河里。转而一想，若没有这最初10年的以污染为代价的原始资本积累，也许就没有30多年来中国最发达的南部沿海经济带和惠、莞、深、港经济走廊，更没有今天的桥头。
