孙中山认为，美国发动美西战争，占有菲律宾，接下立就会侵略中国：“菲律宾群岛转到美国的控制之下，就使美国成为了中国最近的邻邦之一，因之它不可能对中国的情况闭目不理。”1898～1899年，在菲律宾发生了反美独立运动，日本人根积极，显示出了“他们对亚洲同胞的热爱和关怀”，宫崎寅藏、平山周和犬养毅都是菲律宾反美运动的幕后支持者，在他们的介绍下，孙中山与菲律宾独立里运动领导人彭西在东京成功会晤，中国革命党人开始为支持菲律宾革命进行募捐，还帮助彭西在日本购买军火。1899年春夏，经犬养毅介绍，孙中山在日本军火商那里购买到子弹600万发，步枪一万支，火炮11门，望远镜7架，制造军火机一部及其他大批制造弹药的材料，租用日船“布引丸”号，计划驶至马尼拉附近，由菲律宾起义军接收，同船的还有数名日本军官。7月份，该轮船在浙江马鞍岛外水域触礁沉没。1900年1月，孙中山又募集到一笔资金，花了7.5万比索(菲币)从日本再购得第二批军火，准备雇船取道台湾运往菲律宾，但是也没有成功。
孙中山曾对日本宫崎寅藏说：“我们一旦帮助他们争得了菲律宾的独立，接着便可凭借菲律宾同志的力量攻陷广州，掀起了一场大风暴。我决心带领支那的同志和部下去帮他们打仗。” 孙中山还决定“今后应给他们以更多的方便和帮助”。
最后，菲律宾独立军反美失败，但是他们送给孙中山10万日元。
