侦察营赶到现场后立即制定营救计划并进行部署，首先是安排狙击手从远处先击毙一名恐怖分子（狡猾的恐怖分子从不３人同时露面），然后由连长阿姆拉姆·列文率领一组从楼梯向二楼进攻，穆基率另外一组架梯子从窗口进攻。但是，侦察营当时虽然是全军最有特种作战经验的部队，但却从未进行过专门的营救人质训练。下午５点，政府批准了武力营救人质的计划。于是一连串的失误开始了：首先是狙击手为求准确没有瞄准恐怖分子的头部，而是瞄准胸部。被击伤的恐怖分子向同伙发出了警报。这样，从窗口突击的小组被警觉了的恐怖分子投出的手榴弹所阻挡。从楼梯进攻的那一组居然在忙乱中错跑到了３楼，耽误了宝贵的时间。折回２楼后，一名队员又错投了发烟弹，致使室内什么也看不见，突击队员不敢开枪。而丧心病狂的恐怖分子却立即向拥挤在教室里的学生开枪扫射，并投掷手榴弹，造成２０多名人质死亡，５０余人受伤。
马阿洛特惨案震动了以色列全国。已经升任北部军区司令的艾坦将军事后将侦察营长吉奥拉等军官叫到办公室。将军的批评虽然很尖刻，但也非常切中要害：
“也许你们懂得战斗，也许你们知道怎么越过敌人边境行动，也许你们在夜间突击中表现得十分出色。但在这一点上你们不行。我应该让戈兰旅的部队去干这件事，他们会干得更好些。只要我还在北部军区，你们就不要再想到这儿来执行任务了。”
总参侦察营当然感到无比的阵痛和耻辱，从另一方面来说，也更加清醒，立即进行了部队职能的第二次自我完善。根据总参的命令和授权，部队开始加紧准备国防军的全套人质营救作战方案，并召募了４０名新兵，组建了一支名为２６９部队的新分队，专门研究和训练与人质营救有关的课题。根据穆基的回忆录，２６９部队研究和训练的主要内容是：夺取别墅、楼房、船只、火车、飞机、公共汽车等任何可能被恐怖分子占据的目标，突入布满人质的房间，迅速辨认出恐怖分子并将其击毙。由于各种目标的结构都不相同，因此，对突击人员进入目标的方式、武器和火力的配置，以及行动人数等方面的要求也各不相同。侦察营为此认真制定了不同的战斗预案。然后，他们在各种建筑物和公共交通工具的模型和实物上反复演练，很快就研究出了包括狙击、通联、爆破、战斗和营救等一整套手段在内的人质营救技能。２６９部队集中了营里最优秀的官兵，成了一支专业化最强的人质营救分队（侦察营的其他分队也要协助２６９部队参加反恐怖作战，因此，全营官兵都要学习这些人质营救技能）。由于这支分队后来执行任务的机会较多，有些报道便误将２６９部队当成了侦察营的番号。
但是，所有的成就都不会一蹴而就。如果说总参侦察营今日能以其过硬的三大本领――特种侦察、非常规作战和反恐怖作战。而稳居以色列国防军头号特种部队的地位的话，那么，其中每一项本领和成就，都浸透了无数的汗水和心血，更包含着痛苦的教训，这支部队辉煌的纹章是用鲜血铸造的。
