独立的朱由检“初虑不为忠贤所容，深自韬晦，常称病不朝”。在哥哥重病之前，他都没有参与实际政治斗争。直到有一天，病重的朱由校将朱由检叫进宫去。他勉励朱由检说：“你当为尧舜之君！”面对即将到手的帝位，朱由检低调地回答：“臣死罪，陛下说这样的话，臣应万死！”
天启皇帝朱由校8月22日驾崩，第二天魏忠贤宣皇后懿旨将朱由校的死讯布告天下，并以皇帝的口吻宣布：“皇五弟信王由检，聪明夙著，仁孝性成，爰奉祖训，兄终弟及之，文丕绍伦，即皇帝位。”后宫也宣布出皇后的懿旨：“召信王入继大统！”
当天，内阁大学士施凤来、黄立极，英国公张唯贤为首的贵族群臣纷纷前往信王府劝朱由检入宫登基。这是古代历史上的“劝进”传统，早已经发展成了一种仪式。按照惯例，朱由检对群臣们的劝进应该果断地拒绝，以表示自己的谦逊和礼让。群臣再次劝进，再次被朱由检拒绝，第三次再劝进，朱由检才勉强同意，表示自己的即位是民心所向，众望所归。
入宫后，朱由检的心情可以用“心惊胆战”来形容。他虽然没有涉足过政治，没有经历过政治风雨的考验，但也知道当时的实际权力并没有掌握在皇帝手里。他就像是一个伞兵被空投到茫茫无边的敌后，一时的疏忽都可能危及性命。他的父亲朱常洛就是在深幽的紫禁城中不明不白地死去的，一直谨慎的朱由检不得不更加谨慎地对待似乎可得的皇帝宝座。入宫时，他特意穿了一件宽大的衣服，害怕宫中的食物被人下毒，朱由检在袖子里面藏了信王府做的麦饼和准备的饮用水。在入宫的头两天，他就是靠这些东西解决饥渴问题的。进宫后的第一夜，朱由检彻夜未眠，而是秉烛而坐，随时准备处理突发情况。宫中灯火闪烁，下人伺候，一片平静。朱由检始终睁大眼睛，静观事态变化，仿佛置身于危险重重的丛林。深夜，有一队武装太监巡逻而过。朱由检把领头太监叫过来，让他解下佩剑，煞有介事地观赏了起来。最后朱由检把剑放在桌上，给予这名太监重赏。他的兴致似乎很高，紧接着还吩咐宫中为这些巡逻的太监和近侍取来酒菜犒赏。太监们对这位即将登基的信王自然是百般称谢，献媚不已。
8月24日，朱由检在皇极殿举行登基大典，正式成为皇帝，年号崇祯。
