胆囊及胆管疾病
肝脏分泌的胆汁，通过两条肝管分支汇入肝总管中。肝总管距离与胆囊相连的胆囊管约1.5英寸。经过胆总管以后肝胆汁继续流向肠道，但多数都先得通过胆囊。胆囊是从胆管突出的梨形袋状的器官，附着在肝脏的后面（如图5所示）。
正常的胆囊里通常含有2盎司液体状态的胆汁。然而，储存在胆囊里的胆汁，与肝脏里的胆汁浓度有所不同。在胆囊里，胆汁里的大多数盐质跟水份都被重吸收了，因此其容量会减少到仅仅是原来的量的十分之一。胆盐（相对于普通的盐）是不被重吸收的，这意味着它们的浓度呈十倍的增长。另外，胆囊分泌的黏液加入到胆汁里，使其变得像黏液一样地浓稠。胆汁的高浓缩性让其具有强大的辅助消化的能力。
当酸性及大多数的蛋白质食物从胃进入到十二指肠时，胆囊的肌壁会受到刺激而收缩分泌胆汁。值得注意的是，如果进入十二指肠的食物含有高比例的脂肪，胆囊活动则更加明显。机体利用胆汁中的胆盐乳化脂肪使其更加容易被消化。这些胆盐完成了它们的工作以后会继续流向肠道，而乳化的脂肪将在肠道中被吸收。这些被利用过的胆盐会被小肠末段（回肠）重吸收并被带回肝脏。那时，胆盐会再次被收集在胆汁里分泌到十二指肠中。肠道的堵塞会急剧地减少胆汁合成及脂肪消化所需的胆盐数量。胆汁中的胆盐浓度减低会导致胆结石的发生，并且使大量的脂肪物质不能被消化，这对人体整个的消化内环境来说是一场灾难。
胆囊中的胆结石主要是由胆固醇、钙质或像胆红素那样的色素合成的。胆固醇是最普遍的成份，但很多结石都是混合物。除了以上所说的组成部分，胆结石还可能含有胆盐、水份及黏液，还有毒性物质、细菌，偶尔还会有已经死亡的寄生物。
一般来说，结石在胆囊中不断增大长达约八年的时间，机体才会开始出现明显的症状。较大的结石通常会被钙化，因此能用放射学手段或超声学技术轻易地将其检测出来。但胆囊里85%的胆结石直径只有3/4英寸（如图6a所示），尽管有些会增大到2-3英寸（如图6b及图6c所示的被钙化的结石；在我妻子第九次应用肝清洗术毫无痛苦地排石以后，我私下检查及拍下了这些结石；它们会散发出一种莫名的毒性气味）。这些结石的形成是因为胆囊里的胆汁过于饱和、不能被吸收硬化而成的。
如果胆结石滑出胆囊压迫胆囊管或胆总管，它们的管壁会发生强烈的痉挛性收缩（如图3所示）。这样的收缩活动有助于将结石向前推。这会产生严重的疼痛，这就是胆绞痛，并且会伴发胆囊的相当程度的膨胀。如果胆囊里充满了胆结石，胆壁会发生痉挛性收缩而让人体遭受剧烈的疼痛。
胆结石会导致胆囊壁内膜的疼痛及感染，对胆囊管及胆总管也有同样的效果。这种情况被称为胆囊炎。还可能会发生微生菌的逐层感染。致使胆囊、十二指肠或结肠间的组织发生溃疡形成瘘管及纤维化粘连的现象很普遍。
胆囊疾病通常是起源于肝脏。肝胆管被胆结石堵塞后，最终会发展成纤维化组织使肝小叶的结构变形，门静脉的血压开始上升。从而导致从胆囊中运输静脉血到门静脉的胆囊静脉血压上升。胆囊中废物的不完全排泄会导致胆囊合成酸性废料，并阻塞在组织里。这会逐渐减低胆囊的耐力及正常功能的发挥。随之发生的，矿化结石的形成只是时间的问题了。
