安布罗斯得知皇帝下令大屠杀的消息，心中充满悲愤和痛苦，躲到乡下去独自忧伤，不愿与狄奥多西见面。大主教知道自己保持沉默是软弱的表现，在众口铄金之下，使他成为罪恶的帮凶，于是在他写给皇帝的私人信函中，表达出狄奥多西所犯罪行的严重，只有彻底悔改，用眼泪来洗涤自己的罪孽。安布罗斯会因宗教的热忱而激动，也能保持审慎的作为，认为这是上天对他的显灵《安布罗斯书信集》是题材高贵的悲惨史诗，安布罗斯的行为应比写作更为出色才对。他的作品缺乏显明的风格和个人的才华，就德尔图良（Tertullian, Quintus Septimius Florens Tertullianus, 155 A.D.220 A.D.，基督教早期神学家和护教者）的生龙活虎，拉克坦提乌斯（Lactantius, 240 A.D.320 A.D.，基督教辩护家）的文雅华丽，杰罗姆的幽默机智，奥古斯丁的滂沛气势而言，他都无法相比。，要用间接的方式，将皇帝暂时逐出教会。他警告狄奥多西不能用自己的名义献祭，或是当他的面祭神。他劝导皇帝限制自己的行动，专心一意的祈祷，不要妄自接近基督的祭坛，也不要用沾满无辜人民鲜血的双手，去接受圣餐。皇帝受到教父的影响，反省自己的过错，已经深感悔恨，虽然因一时的震怒引起无法挽回的暴行，在万分悲痛之余，仍旧如往常一样前往米兰大教堂参加礼拜活动。
他走到教堂门口的时候，大主教拦住他，用上帝使者的口气和语言对君王说道，仅是私下的忏悔不足以偿还公开犯下的罪行，很难平息神灵被激怒的义愤。狄奥多西很诚挚的表示，要是说他犯下杀人的罪行，那么最为神所喜爱的大卫，他所犯的罪不仅是谋杀，还有通奸［译注］ 以色列国王大卫与将领乌利亚（Uriah）的妻子拔示巴（Bathsheba）发生奸情，让她有了身孕，大卫就使出计谋让乌利亚中伏死亡，然后娶拔示巴为妻，参阅《圣经旧约全书?撒母耳记下》第十一章。。一无所惧的安布罗斯回答：“你学大卫那样犯罪，那么也要像他一样的忏悔。”在接受严苛的赔偿和赎罪条件之后，狄奥多西皇帝的公开忏悔，是教会历史中最光荣的事件。
根据4世纪基督教教规，对杀人犯最宽大的处罚，也需要二十年的苦行赎罪按照圣巴西尔（St.Basil）的赎罪戒律，蓄意杀人要当四年的悔罪者，五年的听道者，七年趴俯在地的悔改者，再加上四年站立的悔改者。我有《圣巴西尔教规书信集》的原本和译本。，把帖撒洛尼卡大屠杀受害人数累计起来，个人有限生命无法偿还。杀人犯便应逐出神圣的教会，直到死亡终结他罪恶的一生。大主教充分考量宗教政策的各项原则，有鉴于悔罪人具有特殊的地位，尤其是身居帝王之尊还能忏悔自责，决定适切放宽条件，何况公开认错能够产生很大的教诲作?，可以作为缩短苦行期的重要理由。对于一个罗马皇帝来说，让他剥去代表君权的服饰，表现出哀悼和恳求的姿态，为了请求赦免罪孽，在米兰的教堂中痛哭流涕，不管怎么说都过得去。在这次心灵治疗过程中，安布罗斯交互采用温和与严格的手法，大约过了八个多月，狄奥多西恢复原有的信仰活动。从他下达一份诏书，把判决延后三十天执行，可以算是忏悔的主要成果。后世一直推崇大主教的刚毅和正直，从狄奥多西的所作所为，证明不怕人世惩罚的君王，屈服于最高审判者的法令，遵从教会执法者的教规，产生非常重要的示范作用。孟德斯鸠（Montesquieu）曾说：“帝王的行动要是被宗教的希望和恐惧所左右，等于是被豢养的狮子，只听从驾驭者的命令和指挥。”百兽之王听命于有权威的人，一举一动要符合控制者的意图和利益。神职人员掌握国君的良知良能，可以煽起或平息杀机四伏的冲动情绪。安布罗斯先后用极大的热忱为人道关怀和宗教迫害出力，同样都获得辉煌的成功。
高卢的僭主战败死去，天下归于狄奥多西所有。原本他虽获得格拉提安拔擢，光荣的名衔仅及于东部各行省，现今则靠着胜利者的权利统治西部。他在意大利度过三年时光，有效恢复法律尊严，过去因马克西穆斯的篡夺，及瓦伦提尼安二世冲龄即位，造成长期无法无天和中枢乏力的局面，已全部改正过来。他颁布的法令都会签署瓦伦提尼安的名字，贾斯蒂娜的儿子年龄尚小，宗教信仰曾误入歧途，势必应由正统教会的监护人精心照顾。这样一来，狄奥多西的野心可以使不幸的年轻人毫无抵抗的能力，很容易将他排除在统治阶层之外，甚至可以剥夺他的帝国继承权。要是狄奥多西根据利害关系和策略需要，不顾一切采用冷酷的手段，他的行事也会得到友人的谅解。在这个极关重要的问题上，他表现出宽宏大量的气概，赢得多年宿敌的赞许。他把瓦伦提尼安拥上米兰的帝座，对于眼前或未来的利益没有提出任何要求，过去马克西穆斯用武力侵占的行省，恢复以后便把统治权交还给瓦伦提尼安。除了大批世袭的领地以外，狄奥多西还慷慨奉送格拉提安被杀以后，靠着自己的英勇所收复的阿尔卑斯山以北的领土。能够为恩主之死报仇，获得解救西部帝国的荣誉，皇帝从米兰回到君士坦丁堡，很安稳的统治东部各行省，渐渐回复昔日奢华而懒慵的生活习惯之中。狄奥多西把国事的重任全权托付给瓦伦提尼安二世的兄弟，与瓦伦提尼安的姊姊结婚，过着夫妻恩爱的宫廷生活。世人推崇他的品格高尚纯真，更为他赢得胜利以后，所表现的慷慨气度而倾心不已。
