同时他们因为明朝政治不良，采用唐朝制度来改革明朝的官制，如改内阁为天佑殿，改翰林院为宏文院，六部为六政府，五军都督府为五军部。各地方行政的府、州、县改为府尹、州牧、县令。虽然是名义上的改变，而用意则在于整理行政机构。对明朝的官吏只录用四品以下的小官，三品以上的官和贵族们一概不用，其贪赃昭著的，发刑官责罚追逼。农民军领袖李自成进城后他本人仍非常俭约，头上戴着白毡帽，身上穿着蓝布上马衣，坐在殿上与牛金星等二十余人，商讨军国大事，确实保存着农民朴素纯挚的作风。又如裁减宦官，不得超过千人。这都是针对着明朝弊政而发的，确乎有其改进的作用。
按照上面所叙述的情况，自成是有组织一个新的，比较能符合人民要求的政府的可能。在军事方面，农民军仍保持着实力，足可以抵御清军的侵入而巩固大顺政权的。但为什么从三月十九日到四月三十日，短短的四十多天，就会急遽地转变，以至于非退出北京不可呢?就其具体的事实，分析起来，不外下列的三个原因：
第一是内部的分裂：李自成所领导的农民军以迅雷闪电的行动，攻取北京，由于胜利的获致，过于迅速顺利，一部分人被胜利冲昏了头脑，不能提高警惕，以致被外界的恶势力所腐蚀。这一派是以刘宗敏、牛金星为首的武人和文人中得势当政派。他们进入北京后，掌握了政权，就认为"天下太平"无事了，于是尽情地享乐。首先占据明朝周皇亲和田皇亲华丽的住宅，夺取大量的财物，把吴三桂的宠妾陈圆圆劫掠过去，朝朝饮宴，夜夜笙歌。长官如此，兵士也从而仿效，掠夺民家物品，诱惑良家妇女，军纪松弛，失去了人民的信仰。另有一派比较清醒的人，像李岩、顾君恩等，他们对于刘宗敏、牛金星等腐化堕落的情况，向李自成提出意见，建议下列四项：
一、扫清大内（皇宫），请主上退居公廨，选定吉期，再议登极。
二、文官追赃，除死难归降外，宜分三等：有贪污者，发刑官严追，尽产入官；抗命不降者，刑官追赃既完，仍定其罪；其清廉者，免刑，听其自输助饷。
三、京师百姓熙熙皞皞，方成帝王之居，一切军兵不宜借住民房，恐失民望。
四、吴镇（吴三桂）兴兵复仇，边报甚急，不可不光孚民望，仍以大国封明太子，令其奉祀宗庙，并招抚吴镇（吴三桂），许以侯爵，则一统之基可成，而干戈之乱可息。
