各国选定被告的根据和角度不同，人数也不等。美国提出30人，澳大利亚提出100人，英国提出11人。澳大利亚的名单中有天皇和相当部分的财阀，而英国反对。英国首相丘吉尔主张从快处决。英国检察官卡尔提出，审判结果应对世界产生重大影响，被告最多也只能为20人，这样可以免去搜集证据的繁琐工作，及早开庭审判。为了提高检察工作的效率，检察局设置于执行委员会，中国检察官向哲?为成员之一。执委会定下了选定被告的标准：能以破坏和平罪起诉；被告团伙从整体上能代表日本政府各部门及战争各时期；被告须是主要决策人；事实确凿。根据上述标准，检察局对已逮捕的100名甲级战犯嫌疑者进行了侦讯。执委会经过表决，确定了首批审判的26名被告。苏联检察团由于美国故意推迟发出邀请而晚到，他们到达后又提出追加5名被告，结果只追加了重光葵和梅津美治郎两人。最后，麦克阿瑟批准被告为28人。
远东国际军事法庭设在东京市之谷原日本陆军省和参谋本部旧址。这个充满贪欲、阴谋、疯狂和杀机，制造战火与灾难的巢穴，而今孤独地站在废墟瓦砾中。审判就是要这样，要深入它的内部，杀死它的罪恶灵魂。它坚固而宽敞的大厅，经过连续几个月的修整和改造，换成一副美国人的气度，傲慢而奢侈。法庭庭长韦伯就在一号战犯东条英机的办公室里办公。
1946年5月3日，远东国际军事法庭正式开庭。
上午8点42分，在一前一后两辆宪兵吉普车的护卫下，一辆美国大型军用客车分开涌动的人潮，"嘎吱"一声停在了昔日日军陆军省办公楼前，吉普车上刷着宪兵的英文缩写"MP"；囚运战犯的客车有老式电车那么大，涂着战时流行的深土黄色，车头上方用英文标着"SPECIAL"，译作"特别"。用蓝色纸糊住的车窗紧闭。这几辆车刚一停稳，等候多时、来自世界各国的几百名新闻记者便蜂拥而上，把车围个水泄不通。军事法庭的宪兵队长坎沃奇跳下吉普车，以冷峻逼人的威仪，在人群中分开一条狭窄的通道。
囚车半腰的铁门打开了。几名戴着白色头盔、挎着卡宾枪的美国宪兵跳下车。车门口静默了片刻，一个穿戴着日本国民衣帽、满脸白胡须的人走下囚车踏板。"南次郎!陆军大将南次郎!"人群又有力而缓慢地涌动。随后，战犯们依次走下囚车：前首相广田弘毅眼睛凹陷，陆军元帅?俊六干枯瘦瘪，以善搞阴谋著称的陆军大将土肥原贤二穿着西装，前首相小矶国昭摆动着双肩，另一个阴谋家桥本欣五郎也穿着开领西服，病殃殃的海军元帅永野修身肩上扛着个硕大的脑袋，陆军大将松井石根手持佛珠，法西斯理论家大川周明拉拉塌塌……
"东条英机！"当东条英机走出来的时候，人群中的激动情绪达到了高潮，嘲骂和诅咒声迭起。然而这个狂风一样凶残的前首相却选择了微笑的面具，右手背手身后，从容迈步，仿佛死过一回，对一切都有了大彻大悟，把这样的结局和场面当作了儿戏。但人们分明看到了他藏于腹中的比刀锋还要锐利的残酷。人们的感情像烈火烧遍全身直至发梢："杀了这个大刽子手!"杀了他!杀了他!
这群被拔除了利齿和筋骨的野兽，裹带着悲哀、恐惧、仇恨和无奈，穿过愤怒的甬道，慢腾腾地向法庭大门走去。这十几米的路如同几十个酷暑和严冬，上下飞舞着沉甸甸的火花和雪片。
大门的旁边钉着一块暗褐色的标牌，上有两行粗黑的英文："INTERNATIONAL MILITARY TRIBUNAL FAR EAST"
远东国际军事法庭。
