从两个层面上来说，琼斯的计算令人印象深刻。在电脑普及以前，计算股票的波幅是件费力的事，而琼斯和他为数不多的员工在两年时间里完成了约 2 000家公司波幅的计算。但是，这只是学术概念的突出性容易为人所知，而不是琼斯的耐心。他的这种费劲的技术反映了 20世纪五六十年代金融学术界的重大突破。
1952年，就在琼斯创立自己的基金3年后，随着一篇名为《投资组合选择》（PortfolioSelection）短文的发表，现代投资组合理论诞生了。文章的作者是位年仅25岁的硕士生，叫哈里·马科维茨（HarryMarkowitz）。他的主要观点有两个方面：其一，投资的艺术不仅仅是将收益最大化，而是将风险调整收益最大化；其二，投资者所承担的风险大小不仅取决于他所拥有的股票，还取决于股票之间的相关性。琼斯的投资方法和这两点基本吻合。通过关注股票的速率，琼斯有效地控制了风险，这与马科维茨的主张不谋而合。而且，通过平衡多头头寸和空头头寸的波动性，琼斯的方法反映了马科维茨的“投资组合风险取决于股票之间的相关性”的观点。
琼斯的方法比马科维茨的理论更实用。因为不具有可操作性， 1952年的这篇文章在华尔街被忽视了好些年：算出 1 000只股票的相关性需要 500 000次的计算，而必要的计算机设施却跟不上。 20世纪 50年代中期，马科维茨不过试图估算 25只股票的相关性，就发现耶鲁经济系连这个对计算机内存的要求也满足不了。这也促使另一个未来的诺贝尔奖获得者威廉 ·夏普（ William Sharpe）着手对其进行改进，使马科维茨的结论变得可操作。在一篇名为《投资分析的简化模型》（A Simplified Model for Portfolio Analysis）的论文中，夏普用一个更简单的方法代替了股票之间的复杂关系的计算——计算每只股票和大盘指数之间的相关性。这完全就是琼斯发明的速率计算。到 1963年夏普发表这篇论文的时候，琼斯用这个方法已经不止 10年了。琼斯还反映了另一名诺贝尔奖获得者、现代投资组合理论之父詹姆斯 ·托宾（ James Tobin）的成果。
托宾在 1958年提出了一个后来被称为“分离理论”的想法，这个理论认为，投资者对股票的选择应该与他的风险偏好分开。 20世纪 50年代，许多投资顾问都认定特定类型的股票适合于特定类型的投资者：寡妇就不适合施乐之类的高风险股票，而一个成功的企业主管也不应该对美国电报电话公司之类的没什么起伏的股票感兴趣。托宾的观点在于为什么这是错误的，投资者对股票的选择可以与他愿意承担的风险大小没有关系。如果投资者是风险厌恶型，他就应该购买最好的股票，但只用他积蓄的一部分；如果投资者是风险偏爱型，他应该购买完全一样的股票，并借钱来买更多。
但在托宾发表这篇具有开创意义的文章之前 9年，琼斯就有了同样的观点。他的基金决定的第一件事就是买哪些公司的股票，第二就是用杠杆效应决定冒多大的风险。
20世纪五六十年代，几乎没人理解琼斯的投资方法。基于他一贯的秘密癖，琼斯预示了对冲基金业的未来。在欧洲的秘密活动教会他如何在危机遍布的环境中生存，他有很多理由将同样的方式用于金融。首先，琼斯不想让竞争对手知道他的投资方法：去过琼斯在百老汇街办公室的经纪人大力盘问他们看好的股票，不过最后还是不知道他们的想法。同样，琼斯尽量避免别人注意到修华及柯塞尔律师事务所（ Seward & Kissel）的律师理查德 ·瓦伦丁（ Richard Valentine）为他设计的税收漏洞。
