水——最彻底的清洁剂
每隔一段时间，最好能让消化系统休息，只喝泉水、过滤水或蒸馏水（distilled water），这叫“水断食”。
断食可以让积存体内的毒素排出，一般人断食一到三天都可，长时间的断食最好在有经验的人指导之下实行。过于虚弱的人，不适合完全以水断食，隔一两天需以蔬菜水果汁补充。在断食之前，最好先有一段减食期。断食完毕，也要有一段复食期。先以汤汁如米汤或蔬菜水果汁开始，再慢慢增加固体食物，否则肠胃不适应，会造成腹胀难忍的痛苦。若方法错误，对身体不但无益，反而有害，有时也十分危险，最好有专家指导。
在今日污染的环境下，“水断食”已经比较不适用。用蔬果汁、蔬菜汤或草药茶断食较为理想，可以都采用或择一来用。
家庭灌肠法
在某些情况下有必要实施灌肠，如断食期间进食流质食物四天以上，大肠会停止蠕动，此时如不灌肠，毒素会积存肠内，再经血液循环被吸收回去。大肠失去自然蠕动的能力会引起便秘（长期吃加工食品，或是含有防腐剂、农药残毒的食物容易导致便秘），在自然蠕动恢复期间也需灌肠。
灌肠方法分两种：第一种是热水袋式灌肠法，第二种是灌肠板（Colema Board）式灌肠法。第一种容易实行，第二种需有较专门的器材，因此在此只介绍第一种热水袋式灌肠法。
器材：灌肠袋（Enema Bag）及管子。
(1) 清水灌肠
灌肠袋装满接近体温的过滤水，约4杯左右。将袋子挂在厕所门内的把手高度，让水流到插管管口，再夹住管子，以排除管内空气。以左半身侧躺在铺了毛巾的地板上，将插管涂点植物油插入肛门。放水，让4杯水进入大肠，有任何不适时将管子夹住，休息片刻再放水。如果肠内塞满粪便，灌一部分水，要先拉出一部分，分几次才能放进4杯水。（平常人干净的肠内可容纳16杯水，但家庭灌肠法一次用4杯水就够了。）
(2) 咖啡灌肠
咖啡灌肠有排肝毒的功效，也有止痛（如头痛）的作用。
用3汤匙有机咖啡粉（含咖啡因）和4杯水煮滚15分钟，再过滤。等咖啡凉到近体温时，放进灌肠袋，用上述同样的方法灌肠，保留咖啡在肠内20分钟再排出来。（咖啡灌肠前需先以清水灌肠一次。）
(3) 排宿便
6汤匙有机咖啡粉和8杯水同煮，与上述做法相同。但灌肠时一次只放半杯咖啡入肛门，并从直肠部分开始按摩肠子，顺着肠子到左小腹。每半杯再按摩几寸，横过肚子，再顺着右小腹往下，当按摩完整个大肠，8杯咖啡也用完，全程大约一小时左右，然后排出体外所有废物。宿便的颜色是黑色，样子像黑胶一般，最后用清水灌肠清洗一次。如果找不到大肠，可以跪着趴在地上，用手摸小腹区，就比较容易感觉到大肠位置。
灌完肠后需补充大肠友善细菌（请参阅“消化系统、友善细菌、酵素”一节）。
