而在玄武门之变大局已定后，那些当年拥戴李建成的臣将们，也将迎来他们人生的转折。按照以往封建官场的剧本，等待他们的，也许会是残暴的清算。李世民并不是一个心慈手软的人，就在玄武门之变发生当天，李建成和李元吉的5个儿女就都被李世民处死，彻底地斩草除根。那么，对于李建成和李元吉当年的部将谋士们，这些多年以来一直帮助李建成和自己作对的人，李世民又会给出怎样的惩罚呢?
最早被李世民清算的，是宰相裴寂。早年李渊在为储君人选犹豫不定的时候，就是裴寂建议“立长，可保国家皇位传承制度明晰”，一句话让李渊坚定了决心。而在此之前，裴寂就是一个总与李世民“作对”的人。早年李渊太原起兵，开始征天下大业时，在大军选择东进还是西征的问题上，裴寂就与李世民意见相左，但裴寂开罪于李世民，主要是因为“刘文静事件”。刘文静是李世民的亲信，在李唐建国之后，刘文静和裴寂争权，此时已是李渊股肱之臣的裴寂借机给刘文静设套，诬陷刘文静有谋反之心，结果刘文静以及其弟刘文起皆遭李渊诛杀，作为李世民早期最重要的谋士，刘文静的死对李世民是一个沉重打击，加上在立储问题上的“立长”论，裴寂不遭李世民恨，那是不可能的。
玄武门之变后，面对李建成已死的结局，裴寂脑子转弯还算快，立刻附和李世民，向李渊建言“宣布李建成罪状”，李世民能够在3天之后立为皇太子，并在一个月后成功登基，裴寂确实是起到了重要作用。在李世民即位的早期，对裴寂礼遇有加，多有厚赐，在即位第一年的祭祀大典上，更赐予他与自己同乘一车，以示恩宠。但短暂的蜜月期后，随着李世民帝位的日益稳固，裴寂的命运开始发生转折。公元628年，唐朝发生“妖僧案”。一个叫法雅的和尚四处散布对李世民不满的言论，而这个和尚偏偏又与裴寂交好，李世民以此为由，将裴寂免职回家，不久之后，裴寂家的奴仆又告发裴寂归家后多有怨言，且与当地妖僧结交，李世民随即宣告裴寂“四大罪”，将裴寂流放广西静州。曾经的大唐王朝开国重臣，落得郁郁而终的结局。
相比于裴寂，许多人却是幸运的，他们曾经为李建成出生入死，与李世民针锋相对，然而在玄武门之变后，李世民并未因为当年的仇怨而大搞清算，相反既往不咎，推心置腹，他们也因此在贞观年间这个盛世上，成就了属于自己的功业。
