中医不但用五行的特性来描述五藏的功能，而且还将五方、五时、五气、五味、五色等分别配入五行，一起来说明五脏功能。当用一个比喻无法说明时，只好再用一个比喻，比喻多了，自然就构成了一个系统。这样一来，五行就成了一个人与自然相结合的完整系统。
我们以心为例，《素问?阴阳应象大论》曰：“南方生热，热生火，火生苦，苦生心，心生血。”《灵枢?五味》曰：“心病者，宜食麦、羊肉、杏、薤”这几样食物都属苦味，因为“苦生心”。
中医将人体五藏比喻成五行，不是为了好玩，而是为了借用五行的生克制化，来进一步说明五藏之间的相互关系。
五藏的资生关系是：肝生心，即木生火，如肝藏血可以济心；心生脾，即火生土，如心阳可以温脾；脾生肺，即土生金，如脾运化水谷之精可以充肺；肺生肾，即金生水，如肺气清肃下行有利于肾纳气；肾生肝，即水生木，如肾精可以滋养肝血。
五藏的相互制约关系是：肾制约心，即水克火，如肾水可以制约心火；心制约肺，即火克金，如心火之热可以防止肺气清肃太过；肺制约肝，即金克木，如肺气肃降牵制肝气升发；肝制约脾，即木克土，如肝气条达能疏脾；脾制约肾，即土克水，如脾之健运可控制肾水泛滥。
中医五行配五藏的学说，非常先进，它将看似毫不相干的五藏统一在一个体系中，并从生克制化关系中体现相互之间的联系。如肝的健康，不但与心有关（肝生心，心反过来也可以影响肝），而且与脾肺都有关系。同时，五脏再配以五方、五色、五气，又将人体五脏与外在自然联系到一起，体现人与自然的相互关系。
根据五行学，人体五藏在生理上的相互联系，决定了它们在病理上也存在相互影响的关系，一藏的病变可以传至其他藏，其他藏的病变也可以传到此藏，中医将此称为“传变”，其依据就是五行的生、克、乘、侮关系。
1、相生关系的传变。
五脏相生的次序为：肝生心，心生脾，脾生肺，肺生肾，肾生肝；
母病及子。是指疾病顺着相生次序传变，即母藏先病，然后按母子相生关系传到子藏。例如，肾属水肝属木，水能生木，所以肾为母藏，肝为子藏。当肾藏病后，它可以传给肝藏，这就是母及子。按照五行的相生关系，肝病传心，心病传脾，脾病传肺，肺病传肾。临床上常见的“水不涵木”病症，就是由于肾阴不足，不能滋养肝阴，引起肝肾阴虚，阴虚则不能制阳，导致肝阳上亢。
子病及母。是指疾病逆着相生次序的传变，即子藏先病，然后按母子相生关系反过来传给母藏。例如，肝属木，心属火，木能生火，故肝为母，心为子。逆相生的传变有两类：一类“子病犯母”，即子实引起的母实病症；一类是“子盗母气”，即子虚引起的母虚病症。
2、相克关系的传变。
五藏相克的次序为：肝克脾，脾克肾，肾克心，心克肺，肺克肝。
在五行中，相克中间会有两种情况，一是“相乘”，二是“相侮”，五藏疾病按相克来推算的话，也有这两种情况，即顺着或逆着相克关系在传变。
相乘就是相克太过引起的疾病，它顺着相克次序传变。以肝和脾的关系为例，肝属木，脾属土，木能克土。有两种情况可以导致肝脾相乘，一是肝气太旺，比正常的脾气高出许多，于是就出现了相克“太过”现象；一是肝气并不旺（与正常相比），但由于脾太虚，肝气趁机大损脾脏。
相侮就是所谓的反克，指疾病逆着相克次序传变。以肺和肝为例，肺属金，肝属木，金克木。但如果肝气太过，或者肺气太虚，都会引起反克，即肺克肝，临床上称为“木侮金”，或“木火刑金”。
