陈宦虽然全身而退，但由他所引起的川滇战火，却已势难收场。
此时周骏虽得成都，但其所处势态却极为尴尬：前部王陵基旅已攻至成都，中军黄鹄举旅还在成渝道中段的简阳、资州、资阳、内江一线磨蹭，而负责断后的刘湘旅尚在泸州，全军的后勤辎重才刚由重庆运到永川——整个儿一首尾不能兼顾的长蛇阵。袁世凯一死，泸州一线的北洋军即刻退下火线撤往重庆集结。正在东大道上摆长蛇阵的周军左侧翼，顿时就空门大开了。
罗佩金眼见陈宦垮台已成定局，乃迅速进据泸州，向周军发动猛烈的侧击：以一部出隆昌，尾追周骏后队；以雷飙旅出富顺攻内江，击败周军张鹏舞团。另一部出攻资州、资阳，与周军黄鹄举旅战于简阳。周军伍青城团临阵倒戈，黄鹄举军溃被杀。另以刘存厚率部自富顺、仁寿绕出新津，堵截周军退路。
而被护国军截断在后，眼见形势逆转的周军旅长刘湘，也在这当口率所部倒戈——他受蔡锷所劝，将泸州让给护国军不争，转率本部直驱永川截击本师军需辎重，结果名利双收：缴获大批军需物资不说（仅子弹便有二百余万发），还得了蔡锷一个川东安抚使的任命。
故周骏虽得成都，但顷刻间便丧失过半兵力。
他眼见护国军大举西上，而川东北洋军又袖手不助，自忖不能抵挡，遂率残部退往川北顺庆一带。后经嘉陵道伊张澜劝说，他遂与王陵基弃军出川逃难，将残部交由顺庆驻军第三师师长钟体道收编。
川军中资格最老，由前清新军第十七镇嫡系血脉延续而来的第一师，至此完全瓦解：
伍青城团（附炮四门，工兵两连）及陈洪范混成旅（附炮四门，工兵一排），为刘存厚之第二师收编；
唐廷牧炮兵团（炮七门），机关枪连（机枪八挺），辎重营、特别营及张鹏舞等步兵团，为钟体道之第三师收编；
此外尚有刘湘率一个团及炮、工、辎各一连，驻永川；王丽中率一个团留守重庆。
后川军耄宿周道刚衔北京政府之命返川，以刘、王两部为基础重建第一师，但终未能再复鼎盛。
二、川滇之战
周骏败逃后，川军第二师师长刘存厚率部抢先进入成都城。
刘师长早在云南当营长时，便和时任团长的罗佩金关系恶劣，所以他一进城，大街小巷里便到处传出“拒罗迎蔡”的口号来。此事虽以蔡锷抱病赶往成都接手川政而告终，但刘、罗矛盾却也进一步恶化。
眼见四川已入蔡锷之手，北京政府被迫承认既成事实，任命蔡为四川督军兼省长，混乱已久的四川局面乃得暂时稳定。
但这个稳定局面相当短暂。
到8月间，蔡锷便因积劳导致喉结核症恶化，同时他亦觉应当功成身退以为天下范，遂决意离开四川，前往日本治疗。
临行前，他向北京政府保举自己的副手罗佩金继任四川督军，黔军首脑人物戴戡继任四川省长。北京回电，同意以罗佩金为护理四川督军兼省长（“护理”是当时常用的一个词，意即“代理”），戴戡为会办四川军务。后又更改为，罗暂署四川督军，戴署四川省长兼会办军务。
谁也没有想到，蔡锷这一去，便再也没有回来——他于当年11月8日，在日本福冈医科大学病院逝世，享年才35岁。
在蔡去世前的11月1日，适逢日本军机演习，他趴在病房的窗前观看，看完后颇受刺激，对陪护他的昔日士官同窗蒋百里叹道：“中国的陆军还没有整理好，而别人的战争准备已经由平面转向立体，我们不知道又落后了多少年！”
