《马可.波罗行纪》共分四卷，第一卷记载了马可.波罗等人东游沿途见闻，直至上都为止。第二卷记载了蒙古大汗忽必烈及其宫殿，都城，朝廷，政府，节庆，游猎等事；自大都南行至杭州，福州，泉州及东地沿岸及诸海诸洲等事；第三卷记载日本、越南、东印度、南印度、印度洋沿岸及诸岛屿，非洲东部，第四卷记君临亚洲的成吉思汗后裔诸鞑靼宗王的战争和亚洲北部的情况。每卷又分章，每章叙述一地的情况或一件史事，共有229章。书中记述的国家、城市的地名达100多个，而这些地方的情况，综合起来，有山川地形、物产、气候、商贾贸易、居民、宗教信仰、风俗习惯等，乃至国家的琐闻佚事，朝章国故，也时时夹见其中。
全书充满了金灿灿的色彩。马可.波罗在《行纪》中以大量的篇章，热情洋溢的语言，记述了中国无穷无尽的财富，巨大的商业城市，极好的交通设施，以及华丽的宫殿建筑。以叙述中国为主的《行纪》第二卷共82章，有很多篇幅是关于忽必烈和大都的描述。这在全书的分量最重，也最吸引人。马可.波罗毫不吝啬地描绘了中国的富庶景象和繁荣的城市、众多的人口。书中称元朝大汗的禁卫军为男爵，共万人。忽必烈每年“颁赐此万名男爵袍服各13次。每次袍色各异..由此共为13色。此种袍服上缀宝石珍珠及其他贵重物品，每年并以金带与袍服共赐此万名男爵，金带甚丽，价值亦巨，每年亦赐13次，..君主亦有袍服13袭，颜色与诸男爵之袍服同。唯较为富丽，而其价值未可以数计也。”马可.波罗还对中国南方富庶的城市有详尽细微的描述。比如杭州。马可.波罗称杭州是世界上最优美和最高贵的城市，共有160万栋房屋，街道宽敞，有运河交通，又有石砌的沟渠排放生活污水。城里的主要大街上有10个大市场，而沿街小巷则有无数个小市场。杭州人对来贸易的外人很亲切，待遇周到，辅助及劝导，尽其所能。杭州人还特别爱卫生，天天洗冷水澡，但对外来之人，则提供热水澡服务，全市有3000座公共澡堂。马可.波罗还提到杭州城外美丽的西湖，湖面上的大小游船如织，以及船上陪伴客人的漂亮女子。杭州人也喜欢坐马车游览全城，常有十几个女子相伴，喝酒唱歌。杭州在马可.波罗眼中就是座人间天堂。
马可.波罗在书中还叙述了东南亚和南亚各国的宫殿和佛塔，特别说到那里富有黄金、珠宝。马可.波罗的叙述中有些荒诞的地方，例如说日本“据有黄金，其数无限，..君主有一大宫，其顶皆用精金为之，..宫廷房室地铺金砖，以代石板，一切窗栊亦用精金，由是此宫之富无限，言之无人能信。”
这样的描述是不可能不引起中世纪的欧洲人震惊的。但是《马可.波罗行纪》其中存在很多纰漏而使他的中国之行的真实性受到质疑。“马可.波罗真的到过中国吗？”中外史学界一直有两种不同的看法。
19世纪初，开始有严肃学者批判《马可.波罗行纪》，并质疑马可.波罗的经历。德国学者徐尔曼是最早提出马可.波罗根本没有到过中国的观点，认为他所谓在元朝17年的历史完全是荒诞的捏造，为游记而编排拙劣的传奇故事，是为了传教士和商人的利益，借以激发感化蒙古人的热情以便到中国通商而创作的。他还说波罗一家三口人最远不过到达大布哈里亚境内，关于蒙古帝国的情况是从曾到过中国的商人们口中听来的；关于印度、波斯、阿拉伯及埃塞俄比亚的叙述则抄自阿拉伯著作。20世纪60年代到80年代，德国汉史学家傅海波、美国学者海格尔，英国学者克雷格.克鲁纳斯等则从游记中的细节提出质疑，发出疑问：“马可.波罗到过中国吗？”与此同时，中国国内学者也有不少人质疑马可.波罗。1995年，英国学者吴芳思经过多年研究，把所有的疑问写成了一本书《马可.波罗到过中国吗？》，从而成为“怀疑论者”的代表。
