但是，多数专家学者承认《李秀成自述》是真实存在的。学者陈旭麓就针对荣孟源的判断反驳说：“《李秀成自述》是李秀成的亲笔。”他说，字句的款讳问题可能仅仅是李秀成的有时疏忽，又回到早年的写法，犯了讳，也并不奇怪。陈旭麓进一步发问：“《李秀成自述》原稿如果是假的，曾国藩为什么要把这个假东西当作宝贝传之后代呢？为什么他的第四代曾孙曾约农还要把这个易招非议的假东西公之于众呢？”而为什么要删除太平军与湘军作战的记录呢？因为李秀成揭露了曾国藩湘军作战的真实情况，与曾国藩利益密切相关。作为统兵大臣，曾国藩向朝廷提供的战况和邀功奏折绝非完全真实，不是瞒报就是夸张。他肯定不能将真实的情况发给朝廷否定自己，所以做了删改。
论证《李秀成自述》真实存在最有力的学者是太平天国史专家罗尔纲先生。他在上个世纪40年代就开始调查此事。他根据从曾国藩后人家中抄录来的《李秀成自述》原稿及拍摄的原稿胶片，从内容笔迹、语汇、用语、语气等方面做出仔细的鉴定，认定“曾国藩后人家藏的《李秀成自述》确是李秀成亲笔”。罗尔纲所著《忠王李秀成自传考证》一文以笔迹考证为标准（李秀成另外留有十几页手迹），断定：“曾国藩后人家藏的《自供》原稿确是忠王亲笔。”质疑原稿真实性的人们常常把曾国藩篡改自述挂在嘴边。罗尔纲仔细整理了曾国藩篡改的四大硬伤，包括篡改李秀成被捕经过、隐瞒湘军围城失误、将洪秀全因病逝世改为服毒自杀、撕毁原稿74页以后内容等。罗尔纲认为这些篡改之处都是曾国藩欺骗清廷、毁灭证据的内容，恰恰“可知这部原稿，并不是冒牌货，而是真的李秀成亲笔写的自述原稿”。《李秀成自述》的台湾原稿影印本的英译本译者、伦敦大学柯文南认为：“我相信我们今天所能细查的《李秀成自述》的确是他亲手写的，而看不出什么重要的、决定性的遗漏。”
