2008年2月27日，用友正式对外宣布成为了微软首家全球独立软件开发商合作伙伴 (Global ISV)，这也是微软在中国的第8家全球战略合作伙伴。
其实，微软早在2006年初，先后向用友发出了四套不同的收购方案。作为国内最大的独立软件开发商，用友的渠道、客户令微软垂涎已久。甚至有人士分析，战略合作并不涉及资本层面是微软对用友收购未果后的折中方案。
用友与微软的深度合作，可以说是用友市场细分策略的战略布局。如果说拒绝微软的收购是王文京商业理想底线的保卫战，那么选择和微软合作则是他的出击，而这一出击背后的深层次原因至少应该包括王文京在细分市场的商业理想出击。
王文京说：“用友成为微软Global ISV，用友将深度利用微软全球领先的技术与平台架构，结合用友在中国及亚洲地区企业应用设计和客户服务的优势,与微软展开全面合作，进行联合创新，为客户提供世界级的企业应用产品、解决方案和服务；同时，微软将与用友分享其产品发展方向和规划，提供深度技术开发支持，对用友新产品开放性能测试实验室，并对相关产品进行认证，使用友的产品保持业界领先的技术地位。”
在达成合作后，王文京透露，用友与微软的合作主要是在三个方面，第一个层面是在产品技术方面的，包括技术支持和协作创新；第二个层面是在市场业务推广方面的；第三个层面主要是在一些管理的交流方面。
其中第一个方面是基础，实际上用友和微软的合作有十几年历史，用友各个阶段的一些产品在技术上也都跟微软开展了相应的合作，但是合作深度最深的，或者说合作面最广的就是U9的开发。U9完全基于.NET平台，是融合多项微软最新技术开发的。
用友开发U9基于.net的平台开始就决定了跟微软建立这个密切的合作关系，因为这里边运行平台和开发工具是基于微软的.net和它的开发工具，所以用友和微软总部的相关的人员频繁交流，用友的人员经常到微软美国总部，微软也有一些专家来指导用友工作。
王文京以用友公司重要的产品U9为例指出，微软从它的.net的运行平台，还有它的对应的开发工具上来进行相应的支持。“当然我们U9本身的产品开发，包括对它的一些工具的应用，也促进微软的一些产品的改进，它的产品也有一些方面的改进的需求，也是我们在U9开发过程之中给它提出的，应该说这是一个互相促进的过程。”
在用友此次携手微软之前，用友已经和IBM建立了良好的合作关系。
目前，用友的产品现在主要是两个平台，一个是微软的net，还有一个是IBM的J2EE。用友与IBM的合作主要在高端产品领域，而与微软的合作主要在中低端产品领域。
据王文京透露，这两个平台在用友所有的产品里面，从营收上说，出自这两个平台的比例差不多是35：65，微软平台占的比例大一些。
显然，与两大巨头的合作带来的好处不仅是得到了良好的开发平台，在一定意义上还为用友提供了对抗SAP、Oracle等老对手的强大武器。
王文京承认，“在大型高端应用上对手们进入早，模型建立丰富，在开展全球化业务上也更成熟”，用友在新产品、新技术的挖掘等方面并不落后国际厂商，通过和微软的合作有助于推动新的商业模式的建立，“希望建立起新的竞争优势”。
作为中国最早从事管理软件开发的软件公司，用友靠财务软件起家,并渗透到管理软件领域，而在平台方面（软件开发需要基础平台，如同开发房地产需要地块一样），包括用友在内，国内软件厂商都没有任何优势，要迅速发展必然需要优良的基础平台。
