因此，费梅鼎请巴赫完全是正常现像。群众有意见的是，当时供职魏玛宫廷的巴赫才十八岁，而且是个小提琴手。但费梅鼎一意孤行。1703年７月，巴赫验收了这部有二十一个音栓和两排键盘的管风琴。工资仅五个金古盾的巴赫把温耀福大师问得面红耳赤。议会要扫费梅鼎的面子：他们要求巴赫当场演奏，却反被巴赫征服：他的弹奏如此轻柔，即使在最强音时，手也保持原状不变。议会覆手为雨，不再按传统公开招聘管风琴乐师，直接聘请巴赫。巴赫一个月后即从魏玛来亚昂上任。这是巴赫第一次成功跳槽，年薪由议会从教堂捐、啤酒税和盖奥尔格医院收入中支付，外带免费住房，不仅超过他的魏玛薪水三倍，而且超过他大哥的工资。只因未婚，巴赫没捞到实物（米、酒等）补贴。
亚昂第一次给了巴赫自由支配的时间。他除了在礼拜上弹奏管风琴，就是作曲。他的处女作复活节康塔塔《你勿弃我灵魂于地狱》完成于亚昂，此亦巴赫康塔塔代表作之一。
与北德不同，萨克森地区当时视多声部对位音乐与和声为下流，连教堂的门都进不了，更不能用于礼拜。但巴赫却热衷于和声音乐。因此，他与亚昂议会的冲突几乎是胎里带来的。一年后，巴赫又与唱诗班学生起冲突。当时他在训练时骂了老捣乱的学生盖巴火。当晚，比巴赫还大几个月的盖学生纠集五个高年级学生在学校黑暗的门廊等到巴赫，棍棒齐举，要巴赫“拿话来说”。
巴老师并不认黄，他拔出佩剑撵得这些学生满坝子跑，最后揪下盖学生的衣服掷地斩得粉碎。那座看见少年巴赫扬眉剑出鞘的门廊，至今尚存。第二天，巴赫报警。但盖爸爸很有势力，盖学生最后只被训戒几句，议会却反过来要求巴赫“用温和的方式上音乐课”。
巴赫出离愤怒。他的回答是跳槽，适逢亚昂西北七十公里的弥豪森管风琴师去世。弥豪森是十六世纪德国牧师闵采尔为奉立新教领导农民大起义的发源地，后起义失败，闵采尔被杀，农民尸横遍野。但他们的血没有白流。几十年后，弥豪森改奉新教。弥豪森议会本已决定由巴赫某表兄接班，可巴赫未婚妻巴魅花与市秘书长是亲戚。于是，巴赫应邀去试奏。巴赫的试奏顺利征服议会，很快拿到聘书。上任后，巴赫在亚昂附近的小村多恩海的圣巴托洛美教堂明媒正娶大他半岁的巴魅花，证婚神父是巴赫哥们儿，堂叔转脸变成老丈人。十八世纪德国的结婚登记十分有趣，翻译如下：
“1707 年10 月17 日，著名而令人尊敬的音乐家、爱深鹤教堂管风琴师、已故安布罗修斯嫡子、单身的弥豪森圣柏莱兹教堂管风琴师约翰·塞巴斯蒂安·巴赫，与原任葛屯管风琴师、令人尊敬的著名音乐家、已故约翰·米歇尔·巴赫之幼女、贤淑处女巴魅花举行婚礼。他们先在亚昂订婚，再来到我们这个神之家，由于吾主的恩宠，成为夫妻。”
巴赫亚昂遗缺由他一个表弟继承，工资却降了。巴赫到弥豪森，工资涨了！巴赫去世后一百八十五年（1935），弥豪森教堂改名巴赫教堂。几年前该教堂募捐装修，得款四百七十万欧元（四千七百万人民币），其中即有一百七十万指定捐给巴赫用过三年的那台管风琴。经“修旧如旧”，这台管风琴被命名为“巴赫管风琴”，至今尚在使用。经现代科学技术检测，它的音调为465赫兹——正宗原装管风琴频率，高于现代管风琴。
