韩复榘上任后不久，山东境内匪情严重。他先后颁布了《守城剿匪办法》以及各种剿匪奖惩办法。韩复榘亲自担任清乡督办和清乡总局局长。鲁南抱犊崮山区（今枣庄境内）是土匪活动猖獗之地，韩复榘自任总指挥亲临前线督剿，前后历时一个半月，作战数十次，斩获土匪数千人。
刘黑七乃流窜华北七省的巨匪，聚众万余，烧杀奸淫抢掠，无恶不作。韩复榘先是派兵进剿，因收效甚微，遂改剿为抚，将刘黑七部改编为山东警备军。未及半年，刘黑七不听调遣，率部窜入河北继续为匪。刘黑七经过霸县时还掘了韩复榘的祖坟，以发泄仇恨。两年后，刘黑七再度窜向鲁西，继续为匪。韩复榘率军严阵以待，亲督手枪旅赴泰安坐镇指挥。由于旷日持久未能剿灭刘匪，韩复榘曾向南京政府递送辞呈，经蒋介石再三挽留，韩复榘才打消辞意，继歼灭刘黑七之后，韩复榘又相继剿灭了山东境内的其他小股土匪。到1935年左右，山东境内的大股土匪已基本肃清。
韩复榘主鲁以后雷厉风行，禁烟禁毒。对于吸食鸦片者，韩复榘的做法是“事不过三”，第一次抓住就打一顿，第二次抓住还是打一顿，如果是第三次抓住，就二话不说直接枪毙。对于抓住的毒品贩子，则无论其叛卖毒品的数量多少，一律枪毙。韩复榘在山东杀人较多，许多人说他“杀人如麻”，动不动就杀人，其实，他杀的人绝大部分都是土匪和烟贩。
共事何思源，礼遇梁漱溟
韩复榘刚刚由河南省政府主席调任山东省政府主席时，新省府班子基本上都是他由河南带来的原班人马，只有教育厅厅长何思源与南京国民政府方面关系密切，又是蒋介石点名安排在山东的。起初，韩复榘认为何思源是蒋介石派来的人，对何思源怀有戒心，十分冷淡。
韩、何之间的第一次交锋是因省财政要削减教育经费引起的。何思源愤而面见韩复榘，态度强硬地表示：教育经费不但不能减少，以后每年还要增加。他还说：“这不是我个人的事，事关后代青年。主席要我干，就得这样，不叫我干，我就走路！”不成想，性格直爽的韩复榘非但没有被触怒，反而起身对他说：“我决不欠你的教育经费，你放心吧！”
正是不打不成交，韩复榘与何思源从此反倒成了朋友。韩复榘非常赏识何思源的耿直和勇气；何思源则发现“和韩复榘相处很容易，向韩直攻是有效的，对他要爽快些，说话不要转弯抹角。韩复榘虽然好明杀人，但他不是阴险的人”。尽管如此，韩复榘周围的人还是不能容忍何思源的存在，非要把他从山东挤走不可。韩复榘语重心长地对他们说：“全省政府只有何思源一个人是山东人，又是读书人，我们还不能容他？不要越做越小，那样非垮台不可！” 对教育工作，韩复榘总是放手让何思源去做，而且没有向教育界安排过一个私人，这在当时是很难得的。
韩复榘十分尊崇中国传统文化，主张要重新弘扬孔教，以旧道德作新生活，启导民众走入思想的正轨，“在旧道德礼义廉耻孝悌忠信的范围内竭力实行”，他认为只有提倡旧道德，注重“四维”、“八德”，使之在人民心里潜移默化，才能使异端邪说无隙可乘，共产主义思想不禁自息，才能培养起国民千万世的精神命脉。他的这些思想，对他统治山东时在文化教育方面所采取的施政纲领也有一定的影响。
