七月十三日，王阳明于吉安府兴举义兵，率领部队进攻南昌。当天，王阳明向南昌府奉新县、靖安县两位知县刘守绪、万士贤发出指令《行知县刘守绪等袭剿坟厂牌》（《王文成公全书》卷三十一），要他们赶在大军对南昌城发动攻击之前，各自率领精兵三千秘密赶到西山（南昌西边，与南康府交界）处会合，设下伏兵，合力围剿叛军。
王阳明特别交代，必须事先详细查看地势，把握时机，切不可为争功而分散力量，导致失败。情势探查清楚之后，当立刻急报通知阳明，并提醒两位知县留下战功记录，以做日后升赏依据。
王阳明之所以先行设下伏兵，是为了以后大部队攻城之际，防止敌军由小道偷袭，妨碍自己部队的行动自由。如果王阳明的作战计划在战场上一举奏效，那么进攻南昌城的难度就降低了不少。
此外，王阳明又下令江西省各府县的诸将务必在十五日率兵到达临江府清江县的樟树镇（丰城西南约三十公里），王阳明自己则督率吉安府知府伍文定的兵士往樟树镇进发。
知府戴德孺由临江府前来，知府徐琏由袁州府前来，知府邢珣由赣州府前来，通判胡尧元、童琦由瑞州府前来，皆带了众多的兵马。
赣州卫署都指挥佥事余恩、吉安府通判谈储、南昌府推官王 和徐文英、临江府新淦县知县李美、吉安府泰和县知县李楫、吉安府万安县知县王冕、赣州府宁都县知县王天与、抚州通判邹琥、抚州府临川县知县傅南乔等，也率兵前来。
当所有部队都如期到达樟树镇时，王阳明本准备作为巡抚立于坛上发号施令，但却积劳成疾病倒在床。为了振奋军心，王阳明写下一文，将知府伍文定、邢珣、徐琏、戴德孺四人召集到一起，传达自己的意思。《皇明大儒王阳明先生出身靖乱录》中有一句：“伍（军队）不用命者斩队将，队将不用命者斩副将，副将不用命者斩主将。”
王阳明接着又写道：“军中无戏言，此是实语，不相诓也。”
看过这篇文章，伍文定等人尽皆咋舌惊叹。
十七日，病情稍有好转，王阳明便将全军分为十三支部队，其中七支部队（中军，第一至第五军及第七军）为进攻南昌城七道城门的正面进攻部队，剩下六支部队则作为夹击七门中四门的游击部队，并向各军的指挥官详细指示了进击路线和攻击目标等，发布了军令《牌行各哨统兵官进攻屯守》（《王文成公全书》卷十七）。
在军令的末尾，王阳明写道：
承委官员务要竭忠奋勇，擒剿叛逆，以靖国难；如或退缩观望，违犯节制，定以军法论处。军兵人等敢有临阵退缩者，就仰本官遵照本院钦奉敕谕事理，就于军前斩首示众。牌侯事完日缴。
