克林顿不只是希拉里的头号军师，当她遇到攻击时，他也会首先站出来为她辩护。2006年，ABC电视台为“9·11事件”5周年拍摄了两集总时长为5小时的电视纪录片，上集是《9·11袭击的来龙去脉》，下集是《9·11调查委员会报告》。在纪录片中，前克林顿政府和布什总统的疏忽被描绘得有声有色，连事后他们对恐怖分子的反击政策也被刻意忽略或歪曲。该片播出后，克林顿担心希拉里的竞选受到影响。9月11日，克林顿与ABC电视台总裁鲍勃·伊渃交涉，要求严格审核该片的真实性。一位ABC职员也承认说：“这部片子确实有跟事实不符的地方，不过那都是些小细节。”不久，该片制片人剪去了长达70秒的镜头，但克林顿还是表示不满意，他派遣克林顿基金会的律师再次向电视台方面表达了自己的失望，要求他们再作些“修改”。
2007年，在“9·11事件”纪念日中，希拉里为了表示自己对死者及其家属的敬意，暂停连任参议员的竞选。当所有电视台都准备对她进行采访时，她告诉助理，自己将不会接受ABC电视台的访问。虽然希拉里并没说出理由，但所有人都认为，一定是该电视台前一年拍摄的那部纪录片惹恼了克林顿夫妇。
克林顿一开始就认为贝拉克·奥巴马将会成为希拉里通往白宫路上最危险的敌手，但希拉里刚开始并不把奥巴马放在眼里，甚至错误地对奥巴马进行了攻击，这使得她的民意支持率急速下降。
对此，克林顿只能尽量补救，维护妻子。在曼哈顿中心的喜来登酒店，他对现场1000多位捐助者说：“我们得选最好的候选人来当总统，毫无疑问，希拉里就是最好的那个人。”在竞选过程中，筹款活动至关重要，希拉里认为这难不倒她。自从2001年成为参议员以来，她已经筹得了5150万美元，并计划在总统选举中筹得1亿美元，她的筹款人认为这不是问题，她可以筹得1.25亿美元以上，这个数目将会打破布什总统在2004年大选中所创下的筹款纪录。与此同时，克林顿在全国各地为希拉里广泛策划参与许多私人筹款活动，许多人冲着克林顿捐献了“一笔巨款”，被希拉里所忽略的宗教人士们由克林顿出面去游说。除此之外，他还经常代替希拉里致电一些持观望态度的民主党人，希望他们可以尽快作决定支持希拉里。
希拉里深知自己民意支持率的升高很大程度上得益于她跟克林顿的关系，许多美国民众在知道克林顿之前对她一无所知。凡事有好有坏，人们通过克林顿才能认识她，这使得他们根本就不了解希拉里这个人，如果她想要脱颖而出，就必须让民众了解真正的自己。过去她并不是没有尝试过这点，不过都不是那么成功。而现在，她必须成功。
在希拉里与克林顿充满传奇色彩的生涯中，很多人好奇克林顿对希拉里的感情究竟是怎样的，妻子与政治伙伴的角色，究竟哪个的分量更重一些。关于这个问题，人们在茶余饭后众说纷纭。
据克林顿夫妇的一位老相识（20世纪70年代就认识他们了）说：“多数婚姻的基础是相互信任，但他们之间的信任是非同寻常的，更多的是源于一种生存本能，他们都很清楚，绝对不会有人比自己的配偶更能维护自己了。”
希拉里的白宫新闻秘书尼尔·拉蒂莫尔说：“她虽然不说出口，但我们能看出来，她对我们最大的要求就是忠于她和克林顿，保护她，或者保护克林顿。”
克林顿本人则说：“我跟希拉里的婚姻是坚不可摧的，没人可以试图破坏它。”
或许从2001年CNN一个名叫“拉里·金现场”的节目中我们可以获得答案，克林顿说道：“我有许多经验，这可以帮到她。我们曾经一块儿尝试许多东西，有成功的，也有失败的，这对我们来说都是巨大的财富。”
主持人拉里·金继续问他：“那么你爱希拉里吗？”
克林顿回答说：“我非常爱她。”
