八年抗战结束后，中国国内又爆发了三年的解放战争。这一时期，经过多年战乱的国家早已生灵涂炭，民不聊生。
黎锦晖厌恶战争，更厌恶挑起战争的人。解放战争时期，他将全家从重庆的“嘉禾别墅”迁往南京的一处居所，过了一段虽然贫穷但是相对安稳的生活。1949年国民党战败撤退台湾，黎锦晖一家拒绝跟随前往，于是一家七口又迁回上海，住在女儿黎明晖在上海租住的只有10平方米空间的亭子间里，其生活简陋，甚至还不如当年“嘉禾别墅”。但是黎锦晖对此却毫无怨言，一个经过了大风大浪的人，久经人世的沧桑磨炼，不以己悲，心境开阔。
1950年，黎锦晖在上海电影制片厂担任作曲工作，但因为他在新中国依然背负着创作“黄色歌曲”的名声，所以没有创作的权利，只做些民间音乐的搜集整理工作。
到了1957年，“反右”开始，曾经积压在黎锦晖心头的那片乌云再次浮现，《毛毛雨》和《桃花江》作为“黄色音乐”重被提起，成为众矢之的。一时间，黎锦晖创作的“靡靡之音”和颓废情调的艺术观再次成为大众批判的对象。30年代，这位“流行音乐之父”又有了一个新的名号：“黄色音乐鼻祖”。
面对这样的责难，黎锦晖希望组织上重新审核自己作品中的“黄色”内容，他辩解《毛毛雨》和《桃花江》都是在民歌基础上发展起来的歌颂爱情的抒情歌曲，并无色情内容。但组织上却始终没有重新调查，最后黎锦晖只得作罢。
其实处于全国音乐界都在声讨“黄色音乐”的大形势下，就连当时风行的《小燕子》《九九艳阳天》都遭到了批判和禁唱，更何况历史上早有争议的“黎派音乐”呢？
随着反右斗争的日趋激烈，黎锦晖不得不妥协了。1958年，他在《人民音乐》报刊上公开承认：我写黄色音乐到此为止，整整十年，害人又害己。
此后，黎锦晖对于自己的《毛毛雨》和《桃花江》等早期作品，三缄其口，再也不肯提及。一直到他去世，除了写几首儿童歌曲之外，再也没有任何新的音乐创作。
经过了那么多年的风风雨雨，黎锦晖对于眼前的新社会、新政权，多次表现出热爱和拥护来，甘愿在新社会中贡献自己的余生。由于晚年他已经不再作曲了，便为自己树立了另一个宏伟的计划——向学术界提供一些以自己创业经验为基础的资料。这些资料除了已经完成的《我与明月社》、计划中的自传《折腾六十年》外，他还准备以回忆录的方式把“小学教育”、“国语”、“儿童文学”和“音乐生活”等多方面的经验总结成集，以供后人参考。对于这一系列目标宏伟的计划，他曾兴致勃勃地在给女儿黎明阳的信中说：“这些资料，写几年也写不完，老年为社会主义服务，无上光荣，心情舒畅、老当益壮。”
在中国乐坛上名噪一时的音乐家，晚年以后，别无他求，只希望再为社会做点力所能及的事情，才不枉生而为人，曾到人间走一回。
