“文化大革命”中，林彪和“四人帮”出于篡党夺权、颠覆无产阶级专政的罪恶目的，在公安战线上大搞“两个否定”、“一个砸烂”。杨奇清是公安战线威望很高又有丰富斗争经验的领导人，周恩来对他很器重，当时还要他抓一些重要工作。这样，他就成了林彪和“四人帮”及其在公安部的党羽篡夺公安机关领导权、搞阴谋活动的巨大障碍。1968年，他们捏造罪名，竟把杨奇清早年的对敌侦察工作诬为“里通外国”、“资敌通敌”。杨奇清严正指出：这是工作，这不是“里通外国”！这是对敌斗争的需要，怎么能说是“资敌通敌”？
“杨奇清专案组”抛出有关杨奇清的所谓“罪行材料”，诬陷他“盗窃中央档案机密”、“侦控无产阶级司令部”、“里通外国”。甚至连他的父亲和叔父都被说成是叛徒，革命家庭成了“反革命家庭”。1968年3月12日深夜，杨奇清被抓走，送往秦城监狱，监号是“6844”。
被抓一个星期后，监狱里的一个男看守和一个女看守突然闯进杨奇清所在的监房，男的用力打他的胸部，并把他摔倒在地上，用脚狠踢，整整二十多分钟。眼镜被打掉在地上，杨奇清什么也看不见，试图站起来，终因身体支撑不住，又倒在了地上。男看守离开时说：“再打一次，你也差不多了！”杨奇清挨打后，开始咳血。监狱管理人员不但不给他治疗，还认为他是装病。在狱中，专案组直接审讯杨奇清，他们把已写好的材料强迫他签字，杨奇清严词拒绝。他们开口大骂，伸手就打……
杨奇清被逮捕关押达五年之久。“杨奇清专案组”一再对抗周恩来总理的指示，迟迟不予放人。曾有人说：“杨奇清堪称是一面超级盾牌，有效地保障了毛泽东和中共中央的安全。但他无力保障自己的安全。‘文革’爆发后，他被关进他下令修建的秦城监狱，在那里领教了法西斯专政的滋味——经常遭到毒打，以致肺部被打成严重内伤。”
就在杨奇清被抓走的当天，造反派把他的夫人肖彬押到食堂，让她站在桌子上对其进行批斗。从此，上午她在学习班被批，下午被拉到公安部大院挨斗。一些不明真相的工人用力将肖彬的头揪起、按下，致使肖彬的头皮连同头发被扯了下来，鲜血直流。
当时，极端分子为给杨奇清定“罪”，也给他的夫人肖彬罗织了一大堆“罪名”：什么“罗杨死党”、“与杨奇清一起资敌通敌的国民党特务”……尽管肖彬多次接受批斗，但是她拒不承认莫须有的罪名，信任、深爱自己的丈夫，坚信历史总有一天会宣告杨奇清无罪！
1969年3月，肖彬被下放到黑龙江笔架山公安部“五七”干校劳动。一年后，又被送到湖北省沙洋公安部“五七”干校劳动改造——冬天推煤去烧锅炉，夏天挑水、种地、打扫厕所。当年，她日夜思念不在身边的儿女们，可她哪里知道她与儿女们的全部信件都被当权者扣押了。
杨奇清的大女儿杨筱林从北京女子二中以优异的成绩考上二炮医学院，大学毕业后被分配在三○四医院当内科医生。可是，造反派却向该医院寄去了诬陷杨奇清和肖彬的黑材料，使该医院不得不将她下放到哈尔滨二一一医院当护理，每天的工作就是洗纱布。在1969年“珍宝岛事件”发生后，中苏关系十分紧张，造反派竟然无端怀疑她会越境叛国，对她严加防范。最后还是极不放心，强令她按战士待遇复员，到北京第二毛纺厂当工人。1974年，随着父亲问题的逐步解决，杨筱林才恢复了军医职位，补发工资，重回三○四医院工作。日后，她在公安部下属的北京新华实业总公司工作，直至退休。
