1991年美苏冷战结束后，美国成为世界上唯一的超级大国，对其他国家使用武力毫无顾忌。在随后的20年里，美国军队在其他国家打了大小5场战争。美国第42任总统威廉·杰斐逊·克林顿执政时期，进行了1993年的索马里首都摩加迪沙之战和1999年的科索沃战争；第43任总统乔治·沃克·布什，即小布什，2001年发动了阿富汗战争，2003年发动了伊拉克战争，阿富汗战争进行了十多年之久，至今没有收场；现任美国总统奥巴马2011年策划的对利比亚的空中军事打击行动，最后推翻了卡扎菲政府，卡扎菲死于非命。
美国国家安全委员会在美国发动的这些战争中所发挥的重要性是不言而喻的。值得一提的是“9·11”事件后，美国进行的“反恐战争”。
2001年9月11日上午，一些恐怖分子在美国国内劫持了四架民航客机，其中两架客机撞击了美国纽约两幢110层的世界贸易中心大楼，随后两座塔楼相继倒塌；同时，在美国首都华盛顿，一架被劫持的客机撞击了美国国防部所在地五角大楼，五角大楼的一角被撞毁；另一架被劫持的客机坠毁在华盛顿附近。这一系列恐怖袭击行动导致3200人死亡，并造成数千亿美元的直接和间接经济损失。这是美国本土有史以来最严重的人员和财产损失。
美国很快锁定了策划和发动这场令世人震惊的“9·11”事件的元凶，他就是“基地”组织的领导人本·拉登。2001年12月13日，美国国防部播出了本·拉登2001年11月9日在阿富汗录制的一盘录像带，他在录像带中称，“9·11”袭击的毁灭效果超出了他“乐观”的估计。
从“9·11”袭击事件开始，美国国家安全委员会有了一个新的使命——反恐战争。在“9·11”事件的当天晚上，时任总统小布什向全国发表了电视讲话，通报了“9·11”事件的情况，随后立刻召开国家安全委员会会议，决定“严惩策划和发动这些袭击的组织及任何庇护这些组织的国家”。2001年10月7日，美国军队开始大规模进攻阿富汗的“基地”组织和塔利班，“反恐战争”正式打响。小布什还成立了国土安全委员会，建立了国土安全部，与国家安全委员会平行，以加强美国国内安全工作。在小布什的8年总统任期内，负责把持国安会的是两位鹰派人物，即副总统切尼和国防部长拉姆斯菲尔德。
5月1日，美国总统奥巴马在白宫宣布，“基地”组织领导人本·拉登已经被美国军方击毙。美国东部时间晚上11点36分，美国新闻电视台直播了美国总统奥巴马在白宫进行的有关本·拉登被打死的讲话。奥巴马在讲话中说，本·拉登是在巴基斯坦首都伊斯兰堡外的一所房间中被美军士兵击毙的。
2011年5月1日凌晨1时20分左右，两架美军“黑鹰”直升机从阿富汗起飞，直扑距巴基斯坦首都伊斯兰堡约150公里的阿伯塔巴德山城。直升机上运载的是美军特种部队“海豹突击队”的成员。在阿伯塔巴德山城的一座四周有围墙的独栋别墅上空，海豹突击队员迅速从直升机上滑下，向屋内发动了突然袭击。双方发生了交火，屋内有5人被当场打死，其中包括本·拉登和他的一个儿子。美军直升机随后带走了本·拉登的尸体。整个过程持续了40分钟。美军共有15人参加了这次突袭行动，其中大部分是海豹突击队成员，美军无一人伤亡。但一架美军直升机由于“机械故障”迫降，美军立即将其炸毁，以保护机上的机密资料。
