但刘华清却挺高兴：职位高低不在乎，只要有事干就行。
“船办”，作为造船工业、科研领导小组这个共和国非常时期海军装备科研生产最高决策指挥系统的唯一常设机构，级别不高，摊子不大，人手不多，但管的事却不少。它几乎囊括了国防科委和国防工办原先主管的与海军武器装备、科研、生产、试验、使用相关的所有工作，可以说是一个缩微了的国防科委和国防工办。这套工作对刘华清而言，轻车熟路，不过是换了一个办公室而已。当然也有不一样的地方，就是他没有了决策权，而只能提建议、写报告，给上级领导当参谋，出主意。他成了跑龙套办事的人。
刘华清就这样在海军一直“挂”了近两年，直到1970年12月15日，才经中央军委批准，给了他一个正式的“官衔”：海军副参谋长，分管造船工业、科研工作和海军装备建设。具体职责还是“船办”那摊子活儿，只不过有了个“名分”。
林彪集团终于垮台了！1971年9月13日，林彪仓皇出逃，摔死在温都尔汗。随即，其在海军的死党李作鹏等人被一一捉拿归案。
刘华清激动不已，满以为从此玉宇澄清、天下太平了。他直接找到重新复出的海军第一政治委员苏振华，要求组织上就他的所谓“问题”给一个“说法”。
苏振华的答复轻描淡写：“你的问题没有立什么专案，只是找几个人审查了一下。”
审查什么？结果如何？苏守口如瓶，一字未露。
刘华清找到另一位海军主要领导申诉，这位领导人坦诚地告诉他：“据观察，你还是老老实实在干工作，没有什么背后活动。但江青说过，‘刘华清是坏人，不能用’，根据是什么，海军不清楚，也没办法。”
据一位同情刘华清境遇的审案人员私下透露，他的主要问题是反对上海市革命委员会，支持群众组织整江青、张春桥的黑材料，而且有人揭露从北京到上海有一条“黑线”，他是黑后台之一。
刘华清这才恍然大悟：为什么聂帅被打倒之后，自己在国防科委的办公室会遭到秘密搜查，原来是江青、张春桥等人在幕后捣鬼。
