目前我国免费抗病毒治疗项目，在有条件的地区提供一年一次的免费病毒载量检测。成功的抗病毒治疗可以使得病毒载量在治疗3～6个月内降低到检测不到的水平。因此在治疗后6个月内检测病毒载量，可以知道抗病毒治疗的效果。
在欧美国家，医生通常建议在治疗2～8周后检测一次病毒载量，然后每4～8周检测一次病毒载量，直到病毒载量达到检测不到的水平。之后每3～4个月检测一次。治疗2～3年后，如果病毒载量持续处于检测不到的水平，可以每半年检测一次。国内的感染者如果经济能力允许，可以参照以上标准，自费多做几次病毒载量检测。
如果治疗失败，会发生什么？
如果治疗失败，抗病毒药物不能抑制HIV病毒复制，那么通过病毒载量检测，就能检测出血液中病毒的含量；由于HIV的复制，CD4持续受到破坏，免疫系统功能不能恢复正常，或者恢复后就下降，监测CD4细胞检测结果会发现CD4不增加甚至继续下降。如果免疫系统持续恶化，特别是当CD4细胞计数小于200/μl，那么就可能重新发生各种机会性感染。
哪些原因会导致治疗失败？
导致治疗失败的原因有很多，有一些是你不能控制的，比如：
抗病毒药物的副作用： 例如疲乏、腹泻、恶心、呕吐，可能会使你保持良好的依从性有困难。严重的副作用会导致你不能安全地服用抗病毒药物
抗病毒药物吸收不良： 抗病毒药物需要被充分吸收才能发挥作用，药物吸收出现问题，可能会导致治疗失败
药物相互作用： HIV抗病毒药物与你服用的其他药物发生相互作用。这有可能会增加HIV药物的副作用，也可能减少HIV药物的效果（同样，HIV药物也可能会影响你服用的其他药物）
有一些因素是你可能可以控制的：
治疗依从性差: 这是抗病毒治疗失败的最重要原因。漏服药物会导致病毒复制的机会增加，病毒载量增加。为了将病毒抑制到检测不到的水平，你需要严格按照医生的要求服用药物
治疗依从性差，还可能导致耐药发生。漏服药物后病毒复制，从而有可能发生耐药突变，从而导致对治疗方案中的一个或多个药物产生抗药性，也可能对其他你并未使用，但与你治疗方案中药物类似的其他药物产生抗药性。病毒发生耐药突变之后，你当前治疗方案的效果逐渐减弱。因此，耐药发生通常是依从性差的后果，产生耐药突变后会导致治疗失败，并且之后可选的治疗药物也会受限。我国免费抗病毒药物治疗项目提供的药物选择有限，出现耐药突变后，之后的治疗方案选择更为困难
