第二天早上，果然全北京专科以上的学校，一律罢课，并且各校代表齐集北大一院第三十六课堂开会。学生联合会的组织，也就是那个时候形成的。当时各学校的中心，自然是北京大学，至于北大主持这个运动的躯干，要算是新潮社及国民杂志社里面的人。
何思源在《回忆五四运动》中这样记述了当时的情形：
那天，我和同学们走在游行队伍行列中，高举‘外抗强权、内除国贼’的旗帜，群情激昂。队伍浩浩荡荡地向东交民巷使馆界进发，准备向各国使馆抗议示威，沿途并散发传单，高呼口号。游行队伍走到东交民巷西口，受到外国兵的阻拦，乃派代表向各国使馆递交《说帖》。队伍折向外交部，又转往赵家楼曹汝霖住宅。到达曹宅时，大门紧闭。一位高个子同学在学生人梯支撑下爬过墙，跳进院内，打开了大门，群众一拥进入。我冲进院里时，抬头看到大厅前沿挂着“大总统颁”字样的横匾一方，匾上题的什么字，我没顾得看。进入厅堂，看到铺陈非常豪奢，更增添了心中的愤怒。群众在极度愤怒下，冲破军警防卫，痛打了正在曹宅的章宗祥，放火烧了曹宅。起火时我就跟多数学生一道，跑出曹宅，回到学校。在段祺瑞政府警察总监吴炳湘的指挥下，军警逮捕了还没走散的学生30余人，其中有北大的易克嶷、许德珩、杨振声等。
由于游行学生被捕，又展开了罢课斗争。5月6日，成立了北京中等以上学校学生联合会。会址设在马神庙北京大学第二院。这个组织在此后的运动中发挥了很大的作用。当时的学生运动，北大站在最前列，北京和全国的学校都唯北大马首是瞻，所以有一个口号：“罢不罢，看北大。”
6月3日，反动的北洋军阀政府大举逮捕学生，关押在北大文、理、法三院，这就更加激起广大群众的愤怒，引起了更大规模的罢课。
北京学生示威的消息很快传遍全国，天津学生首先响应，接着南京、上海、武汉、浙江、山西、湖南、福建、两广等处学生，也都纷纷起来响应。6月3日，上海各界举行民众大会，号召全国罢工罢市来援助学生。这样，五四运动就从知识分子的范围，扩大到工商各界，形成了全国规模的空前广泛的群众运动高潮，犹如烈火燎原，不可遏止。
至此，反动的北洋军阀政府被迫不得不释放全部被捕学生，下令免去卖国贼曹汝霖、章宗祥、陆宗舆三人的职务，并去电巴黎，令出席和会的中国代表顾维钧、王正廷拒绝签字。
五四爱国运动取得了伟大的胜利。五四运动时，何思源出于爱国热情，特别由于他是山东人，五四运动直接由山东问题引起，所以他曾积极地参加了游行、宣传等活动。
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