当晚，在此洞不远处的金龙寺旁，住着一家姓黄人家，男主人叫黄镇，他的妻子生下了一个样子奇怪的男婴。孩子出生时，哭声若雷，像有气怒，头方形，头发微黄，鼻孔上扬，在他额头中间明显可以看出一条蛇的图形，更可怕的是他的牙，尖锐带勾，正中间两颗是犬牙，舌头一吐很是吓人。因为他出生时，母亲正好在草堆旁倒下，所以黄镇就给他起名为草。黄镇希望这孩子虽生于草，但能在草莽中崛起，成为一个人物。后来觉草字太平，改为巢字。
消息传开了，人们议论纷纷。都传说这孩子就是那条红头黄身的大蟒蛇转世。他本来就是要来人间做皇帝，可是还没有坐稳，真身就被人所杀。杀他真身的是一个朱姓落魄书生，家在宋州，他算出了黄家有皇帝之命，所以赶来破坏掉黄家的风水。但他破坏的还不彻底，黄家仍然有两年的皇帝时间。所以才有了他们的后人朱温叛变黄巢，推翻了只存在两年的大齐政权，而朱温则成了后梁的开国皇帝，黄巢则被逼上了绝路。
明代《永乐大典》里也记载着有关黄巢出生的传说，更有离奇，译文如下：
唐末军阀反王之一的秦宗权在他还是府吏的时候，一日正在安睡，忽然间元神离体，见到一位身穿红衣的小吏手持黄纸书对秦宗权说：府君召你去。秦宗权忙问道：你说的府君是谁呀，你所拿的是何文书？那小吏只是答道：府君召你，我也不知何事也。秦宗权便跟他走了，一路上只见山中隐然，天气昏暗，四顾无人烟。不久终于到了一座城池，四面绝无居民。入城后只见有公府相对，入公府大殿后，官吏进去报告说：秦宗权带到了。
