卡翁达多次在公开场合谈到，是儿子马祖戈死于艾滋病的悲剧促使他踏上征战艾滋病的征程。直到今天，每当提起这段不堪回首的噩梦，老人仍是悲愤难当。
赞比亚是世界上艾滋病高发国家之一，HIV病毒感染率高达百分之三十，人均寿命只有 37岁。自1986年发现首例艾滋病病例以来，已有近百万人死于这种疾病，并留下了逾百万的孤儿。首都卢萨卡街头随处可见无家可归的流浪儿。为了应对艾滋病在非洲大陆迅速蔓延的严峻挑战，卡翁达再次振臂疾呼，亲率赞比亚人民与日益肆虐的艾滋病进行着殊死的搏斗。他鼓励人民要打破对艾滋病的沉默，不要远离和歧视艾滋病患者，向艾滋病宣战而不是向艾滋病患者宣战；宣传”预防胜于治疗”的方针，提倡使用避孕套，与宗教势力和传统习惯进行斗争。2002年3月26日，卡翁达在赞比亚首都卢萨卡当众接受了HIV病毒的检测，以此鼓励国民勇于正视艾滋病，采取积极的防治措施。
几年来，卡翁达建立了3个艾滋病广播站，向全国和7个邻国宣传防治艾滋病的基本科学知识。他创办了六所艾滋病孤儿学校，招收百余名学生。为艾滋病孤儿提供营养食品、医疗服务和上学费用；他创办的的肯尼思·卡翁达非洲儿童基金会旨在战胜艾滋病，经过几年的积极筹备，开始接受各界捐赠。卡翁达2003年5月在波士顿大学演讲时说，艾滋病是”非洲地区21世纪面临的最大敌人”；”我们战胜了奴隶制度、殖民主义和种族隔离制度。现在我们的领导人一定要靠政治意志战胜艾滋病。”谈到他的继任者、赞比亚前总统奇鲁巴公开诋毁使用避孕套时，老人异常愤怒地：”他把人民的生命当儿戏，罪不可赦！”
卡翁达不顾年迈为非洲人民的福祉而奋斗的精神赢得了国际社会的尊重和崇敬。非洲联盟轮值主席、莫桑比克总统希萨诺称赞卡翁达，过去领导非洲人民战胜帝国主义和殖民主义，今天继续带领非洲人民战胜肆虐的艾滋病。2003年5月27日，美国总统布什宣布拨款150亿美元用于战胜艾滋病时说”在像赞比亚前总统这样的人所进行的努力中我们看到希望”，”这位好总统把悲痛化为善举”，为卡翁达在遭受疾病蹂躏的非洲大陆上所树立的榜样而”致敬”。
根据联合国秘书长安南2003年2月的倡议，联合国非洲艾滋病问题特别委员会于当年9月17日在亚的斯亚贝巴正式成立，专门负责研究艾滋病对非洲政治、经济及社会的影响，卡翁达是委员会的20名成员之一，2004年2月开始工作，研究抗击艾滋病的最有效方法，向有关国家政府提供咨询，组织政府官员、专家和艾滋病患者进行交流。
年逾八旬的卡翁达为非洲人民早日遏制艾滋病的扩散，最终战胜这一吞噬人类生命的病魔，在世界各地奔走呼号，足迹遍及五洲。相信并祝愿这位曾成功领导赞比亚人民赢得独立的”国父”在这场抗击艾滋病的鏖战中再度获胜。
