我们还有一个天条是阿里巴巴不做电子政务，有一段时间做电子政务、给政府机关做网站好像变得很流行，我们仍坚持这个原则也许是错的，但这是我们的想法。
因为我在外经贸部工作过18个月，我觉得一个企业不要老是想着跟政府搞好关系，一个企业不要老想着通过政府关系赚钱，应该通过自己实践的能力，你最大的客户不是政府，而是市场。阿里巴巴回到杭州以后，我讲过一句比较过激的话。在创建阿里巴巴的湖畔花园会议上，我说我们跟政府的关系往往是相爱容易，相处太难，爱它们、尊重它们、帮助它们了解电子商务，但不要想办法挣它们的钱，所以我们不做电子政务。
——摘自2005年马云在青岛阿里巴巴网商论坛上的讲话
马云处理政商关系的经典案例，最早可以追溯到他创办中国黄页期间。
马云曾经说起他和浙江省外宣办的一次合作：“我们跟浙江省外宣办合作的项目，叫做金格工程，那是中国的第一个政府上网工程，出来之后媒体一报道，引起了很大的轰动，连美国参议院都发来了贺电。当时浙江省台湾办事处主任杨建新帮了我们不少的忙，他并没给我们钱，而是承认我们。”
马云虽然说“不要老是想着和政府搞好关系”，但是，马云和杭州市政府的关系却非同一般。事实上，马云从不把政府当做重要客户、赚政府的钱，但是，与政府的关系对他来说还是很重要的。
2007年，杭州市委、市政府下发了一个文件—包括徐传化、马云、李书福等在内的150名杭州民营企业家，每年将接受市委、市政府有关部门安排的专项体检和疗养休假。
马云甚至得到过几位省委书记的关注。上海市市委书记俞正声有过“上海为什么出不了马云”的发问，当时引起了上海人很热烈的讨论；广东省省委书记汪洋也发过类似的疑问，“广东为何没有阿里巴巴？”在省委书记的眼中，马云和他的阿里巴巴已不仅仅是一家具有国际竞争力的大型企业，更多的是代表着一种经济发展模式，而这种发展模式正是广东当下经济转型、产业升级的方向所在。
