大火过后高瞻远瞩的
市区重建与扩建
本所与深川成为物资的集散地
本所与深川逐渐町屋化
江户是一个火灾多发城市。最大的一场火灾发生在明历三年（1657年）一月，故称明历大火。这场大火不仅使初见规模的城下町总面积的三分之二化为乌有，就连江户城巨大的天守阁也未能幸免。而这座天守阁，事后也再未被重建。
为重建江户，幕府以消防对策为重点，把寺院、神社和町屋迁移至原大名、旗本等武士宅邸所在地，对市区进行了扩建。
而位于隅田川东岸的本所和深川一带，也作为重建计划中的一部分，得到了开发。首先，幕府于明历大火翌年的万治元年（1658年）决定架设大川桥（两国桥），之后又开凿了竖川和横川（大横川），此二川横贯南北，合称“割下水”，确保了南北物资流通与人员交流的通畅。町人的住宅区町屋虽沿水路保留了下来，但隅田川沿岸的农耕地却被蚕食，成了一片住宅用地。
◇本所、深川原属下总国
这个时期，特别得到建设开发的是横十间川以西，小明木川以北一带。万治二年（1659年），本所和深川被定为武士用地，这一带因而渐渐变成了武士宅邸及寺院、神社的所在地。
虽说此处成了武士宅邸聚集区，但若查阅一下当时的地图便不难看出，不仅大名的上等宅邸中只有俸禄十万石的津轻家，就连大名的中下等以及旗本的宅邸也只占少数。与其形成鲜明对照的是，收入微薄的武士宅邸反而比比皆是。
万治三年，幕府又于此设置了本所奉行[ 在本所设置的奉行。所谓奉行，即江户时代对勘町奉行、寺社奉行与町奉行等的总称。]，本所及深川的开发正式开始了。本所奉行的设置，也表明幕府开始把这一带视为江户的一部分。而在此之前，这两处都属于下总国。
在前面提到的大川桥是连接日本桥与本所间桥梁的正式名称。但人们之所以习惯称之为两国桥，是因为在幕府又于下游架设了一座名为“新大桥”的桥梁后，为了避免混淆而为它起的俗称。所谓“两国”，即它连接的是武藏国[ 日本古代令制国之一。包括现埼玉县、东京都大部及神奈川县川崎市和横滨市大部的大行政区。]与下总国这两个地方。
明历大火后开始开发的本所与深川，到了元禄年间（1688—1703）的经济成长期，更作为町场（商业聚集区）得到了巨大的发展。
与大部分地区为旗本、御家人[ 俸禄万石以下，不准谒见将军的武士。]宅邸的小名木川以北相比，其以南地区则因横川及新开凿的仙台堀、油堀等
水路，而成为四通八达的物资集散地。频繁更换地点的木场，也于元禄十四年（1701年）在深川安营扎寨，并一直沿用至近代。
频频不断的火灾虽使江户几乎成了一片废墟，但它之所以能重建得如此之快，也要归功于作为物资集散地的深川，承担的是对生活必需品以及大量木材的供应。
