这时有人告诉钟南山，“来了一个‘怪’病人”。钟南山马上来到病房检查，见病人病情危重，就建议适量用一点皮质激素，以利于病人肺部炎症的吸收。用了皮质激素后，郭姓患者的肺部炎症出现了吸收，呼吸症状马上得到改善，身体得到充分的氧气后，各方面情况都发生好转，接着病情稳定，然后缓慢进入恢复期，最后终于康复出院，当然是在钟南山到中山市以后了。
所以，当钟南山在中山听到有这种“怪”病后，已经带着疑问的他，立即投入到调查会诊之中。
晚上，中国疾病预防控制中心病毒所副所长梁国栋研究员、传染病所呼吸道传染病室邵祝军副研究员、病毒所流感病毒室徐红研究员、疾病控制与应急处理办公室王茂武副主任一行专家共四人赶到中山市指导防治工作。
专家组到达中山后，负责流行病学调查和临床专家分头工作。临床专家到达医院后，对病人进行了会诊。
1月22日，专家们汇集中山市疾病预防控制中心，与中山市卫生局和有关医疗卫生单位的领导、专家进行了讨论分析，由于已经有了河源市的调查报告，专家们对于这个病已经有了一些感性上的认识，并且初步形成共识，所以比较快地完成了《省专家组关于中山市不明原因肺炎调查报告》。这是中国第一份关于“非典”诊断、流行病学特点、临床表现和治疗原则的文件，在这份文件里正式提出了“非典型肺炎”这个名称。
由于报告专业性太强，使用了大量的医学术语，怕引起读者的阅读障碍，恕我不一一摘录了。
《报告》的第四部分提出了治疗原则，其中值得一提的是，第3点提出“严重病人可酌情使用皮质激素”。
关于使用皮质激素这种治疗方法，当时和现在都在医学界引起不同的争论。观点是不同的。直到后来北京发生部分“非典”康复病人因在治疗中使用了激素而造成骨坏死，人们又把用不用激素的争论提到桌面上。
为什么会有不同的看法呢？
细菌或病毒感染人后，主要是破坏人的免疫功能，而激素也是抑制人的免疫功能的。那么，激素是帮助了敌人还是帮助了自己呢？所以，对用激素有不同的意见。但在抗击“非典”当中，医生们发现，一旦使用了激素，肺部炎症很快就开始吸收，病人缺氧症状马上得到改善。改善了病人的供氧，消除了炎症，病人也就慢慢地进入了恢复期。
钟南山对此看法是，任何事情都是有利有弊，科学的态度是看利大还是弊大。使用激素确实存在着弊端，但现在病人生命危险，而我们又没有找到更好的更有效的抢救办法，那我们就要先救命，命都没有了，免疫功能还有什么用呢？问题在于慎用激素，严格地把握剂量，不可乱用。广东省在这次抗击“非典”中，虽然最早遭遇、感染人数最多，但死亡率却是世界最低的，这与慎用激素是不无关系的。
实践证明，正是稳妥地使用了皮质激素，挽救了不少“非典”患者的生命。后被钟南山院士总结为“三早三合理”治疗方案，即早诊断、早隔离、早治疗，合理使用皮质激素、合理使用呼吸机、合理治疗合并症。
1月23日，广东省卫生厅火速以粤卫办2号文件，将《调查报告》印发地级以上市卫生局和省直、部属驻穗直属医疗卫生单位，要求各级医疗卫生机构掌握“治疗原则”及“预防措施”，对类似病人严加观察和诊治。于是，广东省有了一份关于“非典”的诊断和治疗原则的指引。
同时，这份文件也抄送给卫生部和国家疾病预防控制中心。
这里要说一说，何为“非典型肺炎”了。
其实，“非典型肺炎”并不是一个新名词，它是相对于“典型肺炎”而来的。“典型肺炎”主要为由细菌引起的大叶性肺炎或支气管肺炎。而“非典型肺炎”主要是由支原体为主要病原体，后又发现了其他病原体。例如肺炎支原体、肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体和“军团菌”。“非典型肺炎”的名称起源于1930年末，主要是为了与“典型肺炎”相区别，英文名称为Atypicalpneumonias，简称为“AP”，是指一组具有类似肺炎临床表现、胸部X线特征和对抗生素治疗有反应的肺炎。其临床特点为隐匿性起病，多为干性咳嗽，偶见咯血，肺部听诊较少阳性体征；X线胸片主要表现为间质性浸润；其疾病过程通常较轻，患者很少因此而死亡。
以上所提到的非典型肺炎与我们今天所谈虎色变的“非典”异同在哪儿，它们的症状好像相差无几。但传统的非典型肺炎病症过程较轻，死亡率也很低，最重要的是对抗生素治疗有反应。而今天我们提到的“非典”起病急、病情重，对抗生素治疗没有反应，因此相对死亡率要高。还有一点，它有很强的传染性。主要原因是引起感染的病原体不同，弄明这一点相当重要。
我们已经知道引起典型肺炎的是细菌，引起传统的非典型肺炎的是支原体、衣原体和“军团菌”。而今天我们所谈的“非典”，已经弄明白了是由变种的冠状病毒感染所致。病毒与支原体、衣原体、细菌是不同的病原体。
我们已经知道细菌是单细胞组成的微生物。它们既非植物亦非动物，而且菌细胞与动植物细胞不同，它们没有包含一定数量染色体的细胞核，相反，保存细菌遗传代码的物质，仅是一个染色体，自由漂浮在细胞中。
细菌在足够的营养和适宜的环境条件下，可以独立完成代谢活动，并以分裂的形式进行繁殖，有时每20分钟左右就分裂一次，几乎可以在任何地方存活。有的需要空气，有的则只能在无氧环境下才能存活。说不清有多少细菌在人体内或体表生活着。一个人身上和人体内的细菌比地球上曾经有过的人还多。例如，表皮葡萄球菌生活在人的皮肤表面，每平方厘米便有15万个左右，大体上使其他有害菌无处存活。绿灰链球菌生活在我们的口腔中，全凭数量来阻止带来感染的入侵者。相对而言有害菌的种类很少，但是这少数细菌导致的破坏却是惊人的，它们感染人后所引起的症状很严重，因之而死的人数很多。
中医治疗有一种说法叫“调理”，即人体的内部失去了平衡，就要生病了，需要通过中药来进行“调理”，达到新的平衡。其实，如果说人体的内部失去了平衡，那么主要应该是菌种数量失去了平衡，人体便会出现疾病，这种失衡正是有害菌导致的。如，葡萄球菌与健康人体是处于平衡状态的。但当细菌数量增加得太多时，就会感染人体，细菌将一种毒性酶排出细胞壁之外，它能够杀死为身体供氧的血红细胞，这叫做“外泌毒”；细胞壁内带毒称为“内毒素”。
这时，人体的免疫系统便开始行动了。被称作巨噬细胞的白细胞，担任着整个身体组织的警卫，它们会穿过组织去帮助其他的细胞与感染作斗争。这些“自杀的细胞”会与来犯的细菌及其毒素同归于尽，感染会因此被阻止。如果入侵的细菌数量太大，巨噬细胞将会被压倒，更多的细菌将会突破它们的防线，继续去侵蚀血红细胞。在一场全面发动的进攻中，血红细胞消耗巨大，便会导致躯体开始因缺氧而窒息，有时是致命的。
这就是细菌的感染过程。
当人的自身免疫系统不能战胜入侵的病菌时，人就病倒了。这时，医生主要是用抗生素，因为抗生素能有效地抑制和杀灭感染人体的病菌。抗生素抑制和杀灭细菌，主要是破坏细菌的细胞壁和它的代谢功能。
“典型肺炎”和传统上的“非典型肺炎”是由病菌和支原体、衣原体、“军团菌”所感染的，所以抗生素治疗有效。
