1．非典
非典型肺炎（SARS）于2003年在全球范围内爆发。
SARS疫情于2002年12月在中国广东始发，随后迅速蔓延至越南、加拿大、新加坡、美国等32个国家，到2003年7月SARS疫情得到控制时，共造成全球8437人感染、813人死亡。卫生部于2003年8月16日宣布中国非典型肺炎零病例。至此中国共确诊非典型肺炎病例 5327例，死亡349人。
2．禽流感
H5N1型禽流感病毒自2004年始横扫亚洲各国。
最早的人禽流感病例于1997年出现在香港，当时的H5N1型禽流感病毒感染导致12人发病，其中6人死亡。
据世卫组织统计，截至目前全球共有15个国家和地区的393人感染，其中248人死亡，死亡率达63%。中国从2003年至今共有31人感染，其中21人死亡。
3．手足口病
主要感染人群为儿童的手足口病（HFMD）疫情于2008年1月在中国的安徽阜阳大规模爆发。此后迅速波及广东、天津、宁夏等地，后得到有效控制。截至2008年5月，中国共报告手足口病万余例，死亡40例。
2009年1月中国再度爆发手足口疫情。截至4月23日共累计报告病例230362人，其中79人死亡。
4．疯牛病
美国于2003年12月爆发疯牛病疫情，共造成100余人因进食染有疯牛病的牛肉而死亡。
席卷欧洲的疯牛病危机一度蔓延到西班牙，造成一片恐慌，全国牛肉销量也直线下降。西班牙内阁决定回收并销毁4000吨牛肉和牛骨粉。
5．马尔堡出血热
安哥拉于2004年10月爆发马尔堡出血热（Marburg）疫情，共造成252人感染，其中227人死亡。
6．炭疽
一名英国人在2006年因接触未经处理的动物皮革感染炭疽病毒死亡，成为英国30年来首个死于炭疽病毒的患者。
7．埃博拉出血热
刚果于2007年爆发埃博拉出血热（Ebola），造成至少160人死亡。
8．登革热
巴西里约热内卢州于2008年爆发登革热传染病，共造成万人感染，是2007年的4倍多。
9．霍乱
津巴布韦于2008年爆发霍乱疫情，至少造成87998人感染，3975人死亡。2009年，霍乱疫情在索马里、肯尼亚、马拉维、津巴布韦等国再度爆发。
10．甲型H1N1流感
发端于北美洲的人感染甲型H1N1流感疫情继续在全球蔓延。目前全球已有29个国家和地区报告有人感染猪流感的确诊病例，其中墨西哥、加拿大和美国报告有死亡病例。到4月30日，墨西哥确认或疑似死于猪流感的人数已从前一天的152人上升至159人。
世界卫生组织于2009年4月29日晚在日内瓦宣布，将全球流感大流行警告级别从此前的4级提高到5级。5月12日，世界卫生组织(WHO)确认已发现4694例甲型H1N1流感病例，甲型H1N1流感已造成至少52人死亡。
