据说，两千年来共有一百多万艘船只长眠在这片深蓝色的海下，平均每14海里便有一艘沉船，其中包括几艘带有核武器的苏联潜艇和至少一架配备核弹头的美国战机。到目前为止至少有126枚核弹头在龙三角海域神秘失踪。
连续不断的沉船事故引起了众多科学家的注意和探究，最早的说法是海兽作怪，但随着科学的进步，这一说法只能说是古人的迷信。另外还有飓风说和磁偏角说。飓风说认为日本龙三角区域每年可以制造三十起致命的风暴，是飓风使得一些过往船只的导航仪器在一瞬间全部失灵，导致船只沉没。但是，当今大型的现代化船舶是按照能抵御最坏情况的标准制造的，按理说仅凭一场飓风并不能击沉它们。而磁偏角是由于地球上的南北磁极与地理上的南北极不重合而造成的自然现象，这种偏差在地球上的任何一个位置都存在，并不是日本龙三角所特有的。故磁偏角说也更不可能成立。
当然，不能除去是外星人所为的推测，但这种可能的几率也不是很大。编者认为地球上神秘的事情并不在少数，如果一切都说是外星人所为，外星人忙得过来吗？
还有一种看法是海啸说。在日本龙三角西部的深海区，岩浆具有随时冲破薄弱地壳的威胁。这种事情的发生毫无先兆，其威力之巨足够穿透海面，而且转瞬之间它又可平息下来，却不会留下任何证据。而当大洋板块发生地震的时候，超声波达到海面表层，形成海啸。海啸引发的巨浪时速可以达到800公里以上，这是任何坚固的船只都经受不起的。此外，毁灭性的巨大海啸在生成海浪时，在广阔的洋面上只显露出一米或者比这还低的高度，这种在大洋中所发生的缓慢的浪潮起伏是不易被过往船只所察觉的，它很难引起人们的注意。但大约在二十分钟至一个小时后，灾难就开始降临。如果在海啸发生时又正好赶上飓风，那么遇难船只不要说自救，就连呼救的时间可能都没有了。
如果这个原因能够加以论证，那么它将为我们揭开龙三角的神秘面纱，龙三角也将不再是神秘可怕的海域了。
