非常情况下的非常表决方式，使这群热血青年及时做出了按计划起义的抉择，一致同意1时30分行动。毕重远考虑需要一个统一的指挥，否则难以控制整个局面。但多数人不主张选领导人，他遂提议选一个协调联络员。与会者一致推选毕重远、王洛为联络员。毕重远随即进行起义的部署。
司令走廊两侧门外，由曾瑞森、赵旭、王宝林、范泳分别警戒，防止在肃清司令走廊军官时，有人进入妨碍行动；舰腹中段起重机下的楼梯口，由赵振亚警戒，与曾瑞森等配合，防止有人由此上司令走廊；前甲板准尉住舱附近，由眭世达、韩师忠、孙国桢警戒，在后军官住舱未肃清之前，监视准尉军官行动；军官住舱通往士兵住舱的通道，由任振修将厚钢门关闭，断绝前后来往，并把守在门内；与任振修相反方向的左舷通向军官住舱堵门外，由陈英警戒；通向上层司令走廊的楼梯口，由于家欣警戒，并与任、陈二人互相呼应；左舷军官住舱的两个堵门前，由周正、郑希平两人警戒，监视军官行动。
行动组由10人组成：陈鸿源、王颐桢、武定国、刘懋忠、赵嘉宾、王元方、孙昌、张启钰、秦咸周、李铁羽，在取得武器后，负责缉捕弹压反起义人员、集中看管军官等行动。
未及布置停当，毕重远值更的时间已经临近，他必须回住舱，等待换更。0时刚到，毕重远被唤起值更。他来到司令走廊，同于家欣对了对手表，当时针指到25日1时15分之际，毕重远发出开始起义行动的信号，于家欣随即转告守在281雷达室外的眭世达行动，王洛立即到配电房，切断了舰上通讯联络和警报系统的电路。
不一会儿，于家欣将上甲板的三名哨兵哄到281雷达室，他们随即被陈鸿源、眭世达等缴了械。接着，毕重远又将三名值更人员哄进雷达室。这些士兵深明大义，没有反抗就交出武器，并表示支持起义行动。
此时，值更的军官不知躲到何处睡觉去了，为了防止他突然出现，妨碍行动，毕重远派两人把住通往司令走廊的通道，然后打开司令走廊的枪柜和枪架，并让于家欣迅速通知281雷达室的人员，领取枪支弹药。
武装起来的起义者们，按照预先的部署分头执行各自的任务。陈鸿源等直奔见习舰长卢东阁的寝室。这个卢东阁是海军司令桂永清的把兄弟，原是海军督战处处长，桂永清把他安插到“重庆”号上，是准备让他取代现任舰长邓兆祥的。他平日十分骄横，当陈鸿源敲他门时，还厉声问有什么事。陈鸿源说：“海总来了紧急电报，邓舰长请你。”可他开门后看见的，却是几支黑洞洞的枪口。此刻，他全没了平日的骄横，老老实实地被押到舰尾的盥洗室。
