2009年1月中旬，吉尔吉斯斯坦总理丘季诺夫（IgorChudinov）紧急访问莫斯科，并先后得到普京和梅德韦杰夫的接见。之后不到一周，美国新上任的中央司令部司令彼得雷乌斯便访问比什凯克。而彼得雷乌斯离开一周后，俄罗斯副总理谢琴（IgorSechin）便又到访吉国。就在吉尔吉斯斯坦总统即将奔赴莫斯科的前夕，北约秘书长驻中亚和外高加索特别代表西蒙斯（RobertSimons）还到访了比什凯克。
《今日俄罗斯》的报道说，吉尔吉斯斯坦总统巴基耶夫做出的决定，是在兑现他对上海合作组织所做出的承诺。按照2005年7月5日公布的《上合组织成员国元首宣言》：
“鉴于阿富汗反恐的大规模军事行动已经告一段落，上海合作组织成员国认为，反恐联盟有关各方有必要确定临时使用上海合作组织成员国上述基础设施包括地面基础设施以及地面和空中军事运输通道等，主要指的就是美军的玛纳斯空军基地。及在这些国家驻军的最后期限。”
在这份《元首宣言》的末尾，就有成员国6位元首的签名，其中就包括巴基耶夫。因此，有关他在履行承诺的说法，似乎也不无道理。但是，这并不是故事的全部。实际上，在签署《元首宣言》3个月之后，如前文所述，巴基耶夫仍在与美国国务卿赖斯就基地租金问题讨价还价。当然，这种讨价还价也可能是个幌子，或许他不愿意与美国闹得过僵，因而采取这种方式让美国知难而退。总而言之，无论是出于何种考量，巴基耶夫做出的决定，都是基于对局势的判断。
2008年8月的俄格战争，已经让巴基耶夫深深地意识到，美俄的敌对关系升级后，军事冲突的概率将可能增加，因此，在国境内有一个美军军事基地，可能会给国家安全带来很大的风险。作为日益自信的俄罗斯的近邻，吉尔吉斯自然得考虑邻居所需，毕竟，美国虽好，却终究是“远水”，更何况这“远水”还有可能是“祸水”。因此，当俄罗斯也愿意出价之后，吉尔吉斯斯坦做出了决定。巴基耶夫十分清楚，虽然华盛顿高层心里不爽，但肯定会理解他的决定和苦衷。
有意思的是，在巴基耶夫宣布关闭美军基地的当天，俄罗斯总统梅德韦杰夫对外宣布，俄罗斯将向吉尔吉斯斯坦提供20亿美元的贷款和1 5亿美元援助，同时勾销吉尔吉斯斯坦所欠俄罗斯的1 8亿美元债务。
俄罗斯在吉尔吉斯斯坦也有一个军事基地，即坎特空军基地，这个基地的前身，是苏联于1941年设立的坎特空军基地及飞行员培训学校。在二战时期，这里毕业了1507名军队飞行员。1956年开始，这个基地还培训来自外国的学生，毕业的“著名学生”包括：埃及总统穆巴拉克（HosniMubarak）、叙利亚总统阿萨德（Hafezal-Assad）以及印度空军司令辛格（MarshalDilbaghSingh）。1992年，即在苏联解体之后不久，这个基地的控制权，转到了吉尔吉斯斯坦手中。2003年9月22日，俄吉两国签署了继续租用此基地的双边协议。现在，这里驻扎有俄罗斯空军第五大队的空防力量。
但是，美国绝对不会放弃中亚的军事存在。根据《纽约时报》的报道，如果玛纳斯军事基地被关闭，美国将在中亚另外择址，重新修建一个空军基地。因此，围绕军事基地的较量没有结束，而是刚刚开始。
在巴基耶夫宣布关闭玛纳斯基地前两天，即2009年2月1日，美国副助理国务卿布雷扎曾表示，俄罗斯将在阿布哈兹境内部署海陆空总共4个军事基地的计划已经引起美国的担忧。“作为遏制措施，美国正在考虑是否有必要在格鲁吉亚部署一个军事基地。”
