所以后来基洛夫遇刺有人怀疑是斯大林所为。斯大林本人的确值得怀疑，列宁在世的时候就对斯大林本人的为人作派有过担忧，列宁在1924年的《致全国代表大会的信》上就说过“斯大林同志担任总书记，掌握了无限的权力，他能否永远谨慎地使用这种权力，我没有把握。因此，我建议同志们仔细想个办法，把斯大林从这个位置调开，任命另一个人担任这个职位。这不是小事，或者说，这可能是一件具有决定意义的小事”。［15］列宁离开人世之后，除了斯大林之外，可以接替他的人还有十月革命的军事领导人托洛茨基、共产国际领导人季诺维也夫、长期追随列宁的加米涅夫和党内年轻的理论家布哈林，以及基洛夫。
列宁想把斯大林调开，不过还没有来得及他就去世了。斯大林也想把基洛夫调开，他想让基洛夫到莫斯科工作，基洛夫却没有同意。所以关于基洛夫之死，人们对斯大林的怀疑也合情合理。当然这只是猜测，也许未来也只可能是猜测了。
还有另外一种说法是因为基洛夫的私生活问题，据说基洛夫本人有着非常不凡的个人魅力，和好多女人有着暧昧不清的关系。作为一个政治人物，有这方面的丑闻是令人大跌眼镜的，但是就像好多人说的那样，这样一个蹩脚的理由，也许只是为了给基洛夫本人抹黑。有一些人还找出了另外一些证据，来证明基洛夫是死于外国间谍之手，比如他们有人证实杀死基洛夫的尼古拉耶夫之前曾经数次来往德国领事馆，而当基洛夫本人被杀之后，德国领事回国后再也没有来苏联。
这个尼古拉耶夫为什么要对基洛夫痛下杀手？原来尼古拉耶夫曾经在列宁格勒当过共青团卢日斯克县工业部长，后来又被降职，他觉得组织上对他不够重视，尼古拉耶夫向中央申述求情，结果没有人答理他，他把希望寄托在基洛夫身上。不过要想见基洛夫也不容易，当尼古拉耶夫知道基洛夫要在塔夫里切斯基宫举行列宁格勒市党和苏维埃积极分子会议时，就想方设法要跟基洛夫见面，但是遗憾的是，他找了很多人帮忙，结果大家都不帮他，他情绪激动之下终于混进了开会的地方，在某个转弯处开枪将基洛夫杀死了。
这件事情发生之后，斯大林立即亲自前往列宁格勒参与调查，调查结果还没有公布，他就对外宣称说这个暗杀是由托洛茨基及其反对派策划的。于是斯大林以此为契机，开始为他清洗布哈林、季诺维也夫和加米涅夫等老布尔什维克做舆论准备，这就是所谓的“大清洗”。
