虽然落入敌手，但战斗并未结束。被捕当晚，在苏米达尼上校逼迫他向总部发出一份由叙利亚军事情报机构拟定的电报时，聪明的科恩用事先约定的指法，在第一时间内就将被捕之事告诉了特拉维夫。几天后，叙利亚新闻界向外界正式宣布：“捕获了一名叫卡马尔?阿明?塔贝斯的间谍，他的真实姓名为伊利?科恩，是名以色列军人。”
这条消息立即引发了轩然大波：科恩的朋友塞夫与大约500多名叙利亚公民被捕，其中还包括17位女性，哈图姆上校侥幸被豁免。一场大规模营救科恩的政治战和外交战随即展开：以色列总理艾希科尔立即在特拉维夫召集当地各家报社，希望报纸不要发表相关新闻，这样政府可以采用各种手段营救科恩；以色列外交部、国防部的特派代表、非官方人士等开始在各国制造舆论，间接对叙利亚政府施加压力；不少国家的首脑和知名人士，包括罗马天主教皇保罗四世、法国总统戴高乐和总理埃德加?宫尔、加拿大总理迪芬贝克、国际红十字会及数目惊人的美国、斯堪的纳维亚半岛和南美各国的国会议员、参议员、新闻界人士及各界重要人士都向叙利亚当局发出“对科恩免予死刑”的呼吁，比利时首相胡斯曼、东欧几个共产党国家的领导人甚至亲自到大马上革请求赦免科恩。
也许是因为叙利亚对这位以色列的王牌间谍切齿痛恨吧，这一切营救活动都没有奏效。1965年5月8日，哈菲兹总统签署了科恩的死刑判决书，5月19日凌晨3点30分，伊莱?科恩迎来了他生命的最后时刻——他在大马士革烈士广场被当众处以绞刑！
一代谍王终于完结了他的间谍生涯，摩萨德也就此失去麾下的王牌间谍。整个以色列都将科恩视为民族英雄，叙利亚人则对他耿耿于怀，以至于在科恩死后的几十年里，都不曾将烈士的遗骨归还给亲人。这位王牌间谍生前战斗在敌国核心，死后亦只能长眠于敌国土地上了。
