目前，669特种部队共由4个部分组成，分别是：营救分队、撤离分队、技术分队和CSAR学校，具体见下表：
组成部分
具体描述
营救分队
营救分队是669部队的战斗单位，负责实地抢救受伤人员，这也是最大的一个组成部分。该分队由那些通过全部669部队所有训练课程的队员组成，故成员都具备极高的战斗技能，同时也取得了战斗实习医师资格。该分队对队员的要求是最高的，那些出色的营救分队队员甚至能够在野外的紧急情况下进行简单的外科手术。
撤离分队
该分队主要由那些掌握了基本战斗技能的医生与护士组成。部队所有的护士与大部分的医生都来自以色列国防军其他部门，他们必须要全部通过669部队基本的CSAR训练和空运医疗撤离训练。
技术分队
技术分队主要负责部队的装备维护与新装备的测试。
CASR学校CASR学校主要负责669部队队员的挑选与培训工作，专门的CSAR学校成立于1999年。
起初，669部队的训练曾经在设在温格特陆军基地中的以色列国防军攀登、快速绳降和营救学校进行。在那里，由于硬件设施的问题，一些专业空运救援问题就没有被涉及到，比如怎样将一名脊柱受伤的病患人员安全地用绳索运上一架在上空盘旋的直升机。而且当时也是由部队队员负责给新手上课，这就意味着教师有可能时常中断课程去完成一次营救任务，如此一来，难免会影响课程的完整性和教学的质量。如今669部队成立了自己的CSAR学校，很好地解决了这两个问题。学校负责部队内部救援训练和人员选拔，它按照以色列空军知名的飞行学校模式建立，教官都是富有战斗经验的军官和军士，而且都是专职的。
（一）队员选拔与训练
669部队所担负的任务极其特殊且专业，队员不仅要具备一流的战斗素质，同时也要具备相应的医疗救护知识，669部队的这种天然门槛一开始就将很多人挡在了门外。因此，669部队的成员大多来自各大军校医护专业的学员、国防军中的医护人员或那些具备医护特长及天赋的特种兵。
初步选拔出的队员在进行完基础训练后，将会被根据各自的特长分往相应的分队，然后再在各自的分队接受针对性的专业训练，具体见下表：
分队
训练内容
营救分队
（18个月）营救分队的训练项目主要有：
在以色列国防军特别训练中心进行为期4个月的基本步兵战斗训练；
在国防军医师学校进行为期4个月的战场医学训练；
在特诺夫空军基地进行为期2周的空运救援撤离训练；
